mRNA-seq (NGS) – Ново

Секвенционирањето на mRNA овозможува профилирање на сите транскрипти на mRNA во клетките под специфични услови и е широко користена технологија во различни истражувачки области. Нафтоводот BMKCloud De novo mRNA-seq е дизајниран да ги анализира библиотеките за секвенционирање збогатени со поли-А кога нема достапен референтен геном. Гасоводот започнува со контрола на квалитетот, по што следиде новосклопување на транскрипти и избор на унигенски сет. Анализата на структурата на унигенот предвидува кодирана секвенца (CDS) и едноставни повторувања на секвенци (SSR). Последователно, анализата на диференцијалната експресија наоѓа диференцијално изразени гени (DEGs) меѓу тестираните услови, проследени со функционална прибелешка и збогатување на DEG за да се извлечат биолошки увиди.