Секвенционирање на еукариотска mRNA-NGS
Карактеристики
● Фаќање на поли mRNA пред подготовката на библиотеката
● Изборна подготовка на библиотека за насочување на mRNA за да се овозможи добивање податоци за секвенционирање специфични за низата
● Биоинформатска анализа на генската експресија и структурата на транскриптот
Предности
●Широка експертиза: Нашиот тим обработи над 600.000 примероци во BMKgene, опфаќајќи различни типови примероци како што се клеточни култури, ткива и телесни течности. Ние носиме богато искуство за секој проект и успешно завршивме над 100.000 mRNA-Seq проекти во различни истражувачки домени.
●Ригорозна контрола на квалитетот: Ние имплементираме основни контролни точки во сите фази, од подготовка на примерок и библиотека до секвенционирање и биоинформатика. Овој прецизен мониторинг обезбедува испорака на постојано висококвалитетни резултати, уверувајќи ве дека вашиот проект е во сигурни раце.
●Сеопфатна прибелешка: Ние користиме повеќе бази на податоци за функционално да ги прибележиме диференцијално изразените гени (DEG) и да извршиме соодветни анализи на збогатување. Овој сеопфатен пристап обезбедува увид во клеточните и молекуларните процеси кои се во основата на одговорот на транскриптом, што гарантира дека сте целосно информирани за резултатите од вашиот проект.
●Пост-продажна поддршка: Нашата посветеност се протега надвор од завршувањето на проектот со 3-месечен период на услуга по продажбата. Во ова време, нудиме следење на проектот, помош за решавање проблеми и сесии за прашања и одговори за да одговориме на какви било прашања поврзани со резултатите.
Примерок барања и испорака
| Библиотека | Стратегија за секвенционирање | Препорачани податоци | Контрола на квалитет |
| Поли А збогатен | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 GB | Q30≥85% |
Барања за примероци:
Нуклеотиди:
| Конк.(ng/μl) | Количина (μg) | Чистота | Интегритет | |
| Стандардна библиотека | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Ограничена или никаква контаминација на протеини или ДНК е прикажана на гелот. | За растенија: RIN≥4.0; За животни: RIN≥4,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; ограничена или без основна елевација |
| Насока библиотека | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Ограничена или никаква контаминација на протеини или ДНК е прикажана на гелот. | За растенија: RIN≥4.0; За животни: RIN≥4,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; ограничена или без основна елевација |
● Растенија:
Корен, стебло или ливче: 450 mg
Лист или семе: 300 mg
Овошје: 1,2 гр
●Животно:
СРЦЕ или ЦРЕВА: 300 mg
Висцера или мозок: 240 mg
Мускули: 450 mg
Коски, коса или кожа: 1гр
● Членконоги:
Инсекти: 6гр
Рака: 300 mg
● Цела крв: 1 цевка
● Клетки: 106 клетките
Препорачана испорака на примероци
Контејнер: Цевче за центрифуга од 2 ml (не се препорачува лимена фолија)
Обележување на примерокот: Група+реплика на пр. A1, A2, A3; Б1, Б2, Б3... ...
Испорака:
1. Сув мраз: примероците треба да се пакуваат во вреќи и да се закопаат во сув мраз.
2. Табеларни цевки за РНК: примероците од РНК може да се сушат во епрувета за стабилизација на РНК (на пр. RNAstable®) и да се испратат на собна температура.
Тек на услужна работа
Дизајн на експеримент
Испорака на примероци
Екстракција на РНК
Изградба на библиотека
Секвенционирање
Анализа на податоци
Услуги по продажба
Биоинформатика
Еукариотски Работен тек на анализа на секвенционирање на mRNA
Биоинформатика
ØКонтрола на квалитетот на необработените податоци
ØРеферентно усогласување на геномот
ØАнализа на структурата на преписот
ØКвантификација на изразот
ØАнализа на диференцијални изрази
ØПрибелешка и збогатување на функцијата
Референтно порамнување на геномот
Заситеност на податоци
Примерок корелација и проценка на биолошки реплики
Диференцијално изразени гени (DEGs)
Функционална прибелешка на DEG
Функционално збогатување на DEGs
Истражете ги достигнувањата олеснети од услугите за секвенционирање на еукариотски NGS mRNA на BMKGene преку курирана колекција на публикации.
Хуанг, Л. и сор. (2023) „Триклосан и триклокарбан го ослабуваат миризливиот капацитет на златната рипка со ограничување на препознавањето на мирисот, нарушување на трансдукцијата на миризливи сигнали и вознемирувачка обработка на информациите за миризба“, Истражување за вода, 233, стр. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
Џија, ЛЈ и сор. (2023) „Aspergillus fumigatus го киднапира човечкото p11 за да ги пренасочи фагозомите што содржат габи на не-деградативна патека“, Cell Host & Microbe, 31(3), стр. 373-388.e10. doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
Џин, К. и сор. (2022) „Фактори на транскрипција TCP вклучени во развојот на пукањето на ма бамбусот (Dendrocalamus latiflorus Munro)“, Граници во науката за растенијата, 13, стр. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.
Вен, X. и сор. (2022) „Геномот на Chrysanthemum lavandulifolium и молекуларниот механизам кој лежи во основата на различни типови капитулум“, Истражување за хортикултура, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
Џанг, Јуџие и сор. (2023) „Каскаден нанореактор за подобрување на сонодинамичката терапија на колоректален карцином преку синергетско зголемување на ROS и блокада на автофагија“, Нано денес, 49, стр. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
