DNBSEQ однапред направени библиотеки
Карактеристики
●Платформа:MGI-DNBSEQ-T7
●Режими на секвенционирање:PE150
●Трансфер на библиотеките на Илумина воМГИ:овозможувајќи секвенционирање на големи количини на податоци по ниска цена.
●Контрола на квалитетот на библиотеките пред секвенционирање.
●Секвенционирање на податоци КК и испорака:испорака на извештај за QC и необработени податоци во формат fastq по демултиплексирање и филтрирање на читањата на Q30.
Предности
●Разновидност на услугите за секвенционирање:клиентот може да избере редослед по лента или количина на податоци.
●Висок излез на податоци:1500 Gb/лента
●Испорака на секвенционен извештај за КК:со квалитетни метрики, точност на податоците и севкупни перформанси на проектот за секвенционирање.
●Процес на зрело секвенционирање:со кратко време на пресврт.
●Ригорозна контрола на квалитетот: спроведуваме строги барања за КК за да гарантираме испорака на постојано висококвалитетни резултати.
Примерок барања
| Износ на податоци (X) | Концентрација (qPCR/nM) | Волумен | |
| Делумна лента
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
| Единечна лента | По Лејн | ≥ 1,5 nM / базен на библиотека | ≥ 25 μl / базен на библиотека |
Покрај концентрацијата и вкупната количина, потребна е и соодветна шема на врвови.
Забелешка: Секвенционирањето на ленти на библиотеки со ниска разновидност бара PhiX spike-in за да се обезбеди робусно базно повикување.
Препорачуваме да поднесете претходно здружени библиотеки како примероци. Ако ви треба BMKGENE да изврши здружување на библиотеката, ве молиме погледнете го
библиотечни барања за делумно секвенционирање на ленти.
Големина на библиотеката (највисока карта)
Главниот врв треба да биде во рамките на 300-450 bp.
Библиотеките треба да имаат еден главен врв, без контаминација на адаптерот и без димери за прајмер.
Работен тек на услуги
Извештај за КК на библиотеката
Извештај за квалитетот на библиотеката е даден пред секвенционирање, проценка на количината на библиотеката и фрагментација.
Секвенционирање на извештај за КК
Табела 1. Статистика за секвенционирање на податоци.
| ИД на примерок | BMKID | Суровини чита | Необработени податоци (bp) | Чисти читања (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 часот | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Слика 1. Дистрибуција на квалитет заедно со читањата во секој примерок
Слика 2. Дистрибуција на основна содржина
Слика 3. Распределба на прочитаните содржини во податоците за секвенционирање
