Илумина претходно изработени библиотеки
Карактеристики
●Платформи:Illumina novaseq 6000 и Novaseq x Plus
●Режими за секвенцирање:PE150 и PE250
●Контрола на квалитетот на библиотеките пред секвенционирањето
●Податоци за секвенцирање QC и испорака:Испорака на извештајот за QC и сурови податоци во формат FastQ по Demultiplexing и филтрирање Q30 читаат
Предности на услугата
●Разновидност на услуги за секвенционирање:Клиентот може да избере да се редослед по лента, проток ќелија или по количина на потребни податоци (делумно секвенционирање на лентата).
●Огромно искуство на платформата за секвенционирање на Илумина:со илјадници затворени проекти со разни видови.
●Испорака на секвенционирање на извештајот за QC:со квалитетни метрика, точност на податоците и целокупна изведба на проектот за секвенционирање.
●Зрели процес на секвенционирање:Со кратко време на вртење.
●Ригорозна контрола на квалитетот: Ние имплементираме строги барања за КК за да гарантираме испорака на постојано квалитетни резултати.
Пример платформи
| Платформа | Проток ќелија | Режим на секвенци | Единица | Проценет излез |
| Новасек x | 10б (8 ленти) | PE150 | Единечна лента Делумна лента | 375 GB / лента |
| 25б (8 ленти) | PE150 | Единечна лента Делумна лента | 1000 GB/лента | |
| Новасек 6000 | SP Cell Cell (2 ленти) | PE250 | Проток ќелија Единечна лента Делумна лента | 325-400 m чита / лента |
| S4 проток ќелија (4 ленти) | PE150 | Проток ќелија Единечна лента Делумна лента | 800 GB / лента |
Барања за примероци
| Количина на податоци (x) | Концентрација (qPCR/nm) | Волумен | |
| Делумно секвенционирање на лентата
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
| 10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
| 50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
| X> 100 GB | ≥ 4 nm | ≥ 25 μl | |
| Секвенционирање на лентата | По лента | ≥ 1,5 nm / базен за библиотека | ≥ 25 μl / базен за библиотека |
Покрај концентрацијата и вкупната количина, потребна е и соодветна врвна шема.
Белешка: Редоследот на лентата на библиотеките со ниска разновидност бара Phix Spike-In за да се обезбеди робустен повик на база.
Препорачуваме да ги поднесувате пред-лапнежните библиотеки како примероци. Доколку ви треба BMKgene за да извршите здружување на библиотеката, погледнете
Барањата за библиотека за делумно секвенционирање на лентата.
Големина на библиотеката (врв мапа)
Главниот врв треба да биде во рамките на 300-450 б.п.
Библиотеките треба да имаат единствен главен врв, без загадување на адаптерот и без затемнувачи на буквар.
Ве молиме, посетете ни се доколку вашите примероци не ги исполнуваат барањата за почетен материјал.
Услужен проток на работа
Контрола на квалитетот на библиотеката
Секвенцирање
Контрола на квалитетот на податоците
Испорака на проектот
Извештај за библиотека КК
Извештај за квалитетот на библиотеката е даден пред секвенционирање, проценка на количината на библиотеката и фрагментација.
Извештај за QC за секвенцирање
Табела 1. Статистика за податоци за секвенционирање.
| ИД на примерок | Bmkid | Сурови читања | Сурови податоци (БП) | Чисти читања (%) | П20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870,120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99.14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98,95 | 93.89 | 37.08 |
Слика 1. Дистрибуцијата на квалитетот на квалитетот на секој примерок во секој примерок
Слика 2. Дистрибуција на содржина на основата
Слика 3. Дистрибуција на содржината за читање во податоците за секвенционирање
