Ново собрание на бактериски геном
Обезбедуваме комплетна услуга за склопување на бактериски геном, гарантирајќи 0 празнини. Ова е можно со интегрирање на технологии за секвенционирање долго читање, како што се Nanopore и PacBio за склопување и секвенционирање на кратко читање со Illumina за валидација на склопот и корекција на грешки на читањата на ONT. Нашата услуга обезбедува комплетен биоинформатички работен тек од склопување, функционална прибелешка и напредна биоинформатска анализа, исполнувајќи специфични истражувачки цели. Оваа услуга овозможува развој на прецизни референтни геноми за различни генетски и геномски студии. Дополнително, тој ја формира основата за апликации како што се оптимизација на соеви, генетски инженеринг и развој на микробиолошка технологија, обезбедувајќи сигурни и без празнини геномски податоци клучни за унапредување на научните сознанија и биотехнолошките иновации.
Карактеристики на услугата
● Со две можни опции за избор во зависност од саканиот степен на комплетност на геномот.
l Нацрт Опција за геном: Секвенционирање на кратко читање со Illumina NovaSeq PE150.
● Завршете го геномот од 0 јаз.
● Долго прочитано секвенционирање на Nanopore PromethION 48 или PacBio Revio за склопување на геном.
● Кратко читање секвенционирање на Illumina NovaSeq за валидација на геномот и корекција на грешки (Nanopore) или за генерирање нацрт геном.
Предности на услугата
●Гарантирано геном со нула јаз: Ова се должи на интеграцијата на секвенционирањето на Illumina со секвенционирањето со долго читање (Nanopore или PacBio).
●Комплетен тек на биоинформатика:Ова вклучува склопување на геномот и предвидување на повеќе геномски елементи, функционална генска прибелешка и визуелизации на геномот, како што е заплетот на Циркос.
●Широка експертиза: Со собрани над 20.000 микробиолошки геноми, BMKGENE носи повеќе од една деценија искуство, високо квалификуван тим за анализа, сеопфатна содржина и одлична поддршка по продажбата.
●Поддршка по продажбата:Нашата посветеност се протега надвор од завршувањето на проектот со 3-месечен период на услуга по продажбата. Во ова време, нудиме следење на проектот, помош за решавање проблеми и сесии за прашања и одговори за да одговориме на какви било прашања поврзани со резултатите.
●Достапни се повеќе стратегии за секвенционирање:За различни истражувачки цели и барања за комплетноста на геномот.
Спецификации за услуги
| Услуга | Стратегија за секвенционирање |
| Нацрт геном | Illumina PE150 100x |
| 0 Геном на јазот | Nanopore 100x + Illumina PE150 100x Or Pacbio HiFi 30x + Illumina PE150 100x (опционално) |
Барања за примероци:
| Концентрација (ng/µL) | Вкупна количина (μg) | Волумен (µL) | OD260/280 | OD260/230 | |
| PacBio | ≥20 | ≥1,2 | ≥20 | 1,7-2,2 | ≥1,0 |
| Нанопор | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1,7-2,2 | 1,0-3,0 |
| Илумина | ≥1 | ≥0,06 | ≥20 | - | - |
· Бактерии: ≥3,5x1010 клетките
Тек на услужна работа
Испорака на примероци
Изградба на библиотека
Секвенционирање
Анализа на податоци
Услуги по продажба
Ја вклучува следната анализа:
● Контрола на квалитетот на податоците за секвенционирање
● Собрание на геном
● Анализа на компоненти на геном: предвидување на ЦДС и повеќе геномски елементи
● Функционална прибелешка со повеќе општи бази на податоци (GO, KEGG, итн.) и напредни бази на податоци (CARD, VFDB, итн.)
● Визуелизација на геномот
Го обезбедуваме геномот во лесно достапен фаста формат и датотеката со прибелешки за геномот (gff).
Генска прибелешка – GO
Генска прибелешка – CAZY јаглехидрати
Визуелизација на геном - Циркос заплет
Истражете ги достигнувањата олеснети од услугите за склопување на бактериски геном на BMKGene преку курирана колекција на публикации.
Даи, В. и сор. (2023) „Откривање на Bacteroides uniformis F18-22 како безбедна и нова пробиотска бактерија за третман на улцеративен колитис од здраво човечко дебело црево“,Меѓународен весник на молекуларни науки, 24 (19), стр. 14669. дои: 10.3390/IJMS241914669/S1.
Kang, Q. et al. (2021) „Изолати Proteus mirabilis отпорни на повеќе лекови кои носат blaOXA-1 и blaNDM-1 од дивиот свет во Кина: зголемен ризик за јавното здравје“,Интегративна зоологија, 16 (6), стр. 798–809. doi: 10.1111/1749-4877.12510.
Ванг, ТТ и сор. (2017) „Комплетната геномска секвенца на ендофитот Bacillus flexus KLBMP 4941 го открива неговиот механизам за поттикнување на растот на растенијата и генетска основа за толеранција на сол“,Весник за биотехнологија, 260, стр. 38–41. doi: 10.1016/J.JBIOTEC.2017.09.001.
Ванг, X. et al. (2021) „Плазмидите со отпорност со повеќе реплика на клебсиела посредуваат во екстензивното ширење на антимикробните гени“,Граници во микробиологијата, 12, стр. 754931. дои: 10.3389/FMICB.2021.754931/BIBTEX.
