Секвенционирање на ампликон (16S/18S/ITS)

Amplicon (16S/18S/ITS) секвенционирање со Илумина е метод за анализирање на микробната разновидност со идентификување на микробни профили според нивните секвенци и потоа обид да се дешифрираат богатството и различностите во заедницата во рамките на секој примерок и помеѓу примероците. Гасоводот BMKCloud Amplicon (NGS) овозможува анализа на 16S, 18S, ITS и повеќе функционални гени. Започнува со читање, склопување на склопување и проценка на квалитетот, проследено со групирање на слични читања за да се генерираат оперативни таксономски единици (ОТУ) што се користат во шест различни делови за анализа. Таксономската прибелешка дава информации за релативно изобилство и состав на секој примерок, додека алфа и бета разновидност анализираат фокус на микробна разновидност во и помеѓу примероците, соодветно. Диференцијалната анализа помеѓу групите наоѓа ОТУ кои се разликуваат со употреба на параметарски и непараметриски тестови, додека анализата на корелацијата ги однесува овие разлики со факторите на животната средина. Конечно, функционалното изобилство на гени се предвидува врз основа на изобилство на гени на маркер, обезбедувајќи увид во функцијата и екологијата во секој примерок ..