16S/18S/неговиот секвенционирање на ампликон-пацио
Карактеристики на услугите
● Платформа за секвенционирање: Pacbio Revio
● Режим на секвенционирање: CCS (HIFI чита)
● Засилување на целниот регион проследено со тандем што се поврзува на ампликоните пред подготовката на библиотеката HIFI SMRT Bell
Предности на услугата
●Повисока таксономска резолуција: Т.Секвенционирање на кратки ампликони на Хан,Овозможување повисоки стапки на класификација на OTU на ниво на видови.
●Високо точен повик за база: Секвенционирање на режимот Pacbio CCS (HIFI чита).
●Без изолација: Брза идентификација на микробниот состав во примероците од животната средина.
●Широко применливо: Разновидни студии за микробиолошка заедница.
●Сеопфатна биоинформатичка анализа: Најновиот пакет QIIME2 (квантитативен увид во микробната екологија) со разновидни анализи во однос на базата на податоци, прибележување, OTU/ASV.
●Широка експертиза: Со илјадници проекти за секвенционирање на ампликон, спроведени на годишно ниво, BMKgene носи повеќе од една деценија искуство, високо квалификуван тим за анализа, сеопфатна содржина и одлична поддршка за пост-продажба.
Спецификации на услугите
| Библиотека | Стратегија за секвенцирање | Препорачани податоци |
| Amplicon | Pacbio Revio | 10/30/50 K ознаки (CCS) |
Барања за примероци
| Концентрација (ng/μL) | Вкупна количина (μg) | Волумен (мл) |
| ≥5 | .0.3 | ≥ 20 |
Препорачана испорака на примероци
Замрзнете ги примероците во течен азот за 3-4 часа и чувајте во течен азот или -80 степени до долгорочна резервација. Потребно е испорака на примерок со сув мраз.
Проток на работа на услуги
Испорака на примерок
Библиотека изградба
Секвенцирање
Анализа на податоците
Услуги по продажба
Вклучува следнава анализа:
● Контрола на квалитетот на суровините на податоците
● ОТУ кластерирање/де-бучава (ASV)
● ОТУ анотација
● Анализа на разновидност на алфа: Повеќе индекси, вклучувајќи ги Шенон, Симпсон и Аце.
● Анализа на бета разновидност
● Анализа на меѓу-група
● Анализа на корелација: помеѓу факторите на животната средина и надвор од составот и разновидноста
● 16S Функционално предвидување на генот
Хистограм на таксономска дистрибуција
Филогенетско дрво за дистрибуција на заедницата
Алфа Анализа на разновидност: Аце
индекс
Анализа на бета разновидност: PCOA
Анализа на меѓугрупа: АНОВА
Истражете ги напредокот олеснети со услугите за секвенционирање на ампликонот на BMKGene со Pacbio преку курирана колекција на публикации.
GAO, X. and Wang, H. (2023) 'Компаративна анализа на руменични бактериски профили и функции за време на адаптација на различна фенологија (Regeen vs. Grassy) во алпски мерино овци со две растечки фази на алпска ливада', ферментација, 9 ( 1), стр. 16. doi: 10.3390/ферментација9010016/s1.
Ли, С. и др. (2023) „Фаќање на микробната темна материја во пустинските почви со употреба на метагеномика базирана на културомика и анализа на висока резолуција“, НПЈ биофилмови и микробиоми 2023 9: 1, 9 (1), стр. 1–14. doi: 10.1038/S41522-023-00439-8.
Му, Л. и др. (2022) „Ефекти на соли на масни киселини врз карактеристиките на ферментација, бактериската разновидност и аеробната стабилност на мешаната силажа подготвена со луцерка, ориз од слама и пченица“, весник на науката за храна и земјоделство, 102 (4), стр. 1475– 1487 година. doi: 10.1002/JSFA.11482.
Јанг, Ј и др. (2023) „Интеракцијата помеѓу оксидативните биомаркери на стрес и микробиота на цревата во антиоксидансните ефекти на екстракти од Sonchus brachyotus DC. Кај цревниот оксидативен стрес предизвикан од оксазолон кај возрасни зебрафиш, антиоксиданти 2023, том. 12, страница 192, 12 (1), стр. 192. doi: 10.3390/antiox12010192.
