16S/18S/ITS Секвенционирање на засилувачи-NGS
Карактеристики на услугата
● Платформа за секвенционирање: Illumina NovaSeq.
● Засилување на кратки региони од 16S, 18S и ITS, меѓу другите цели за засилување.
● Флексибилен избор на ампликони.
● Претходно искуство со проекти со повеќе цели за засилување.
Предности на услугата
●Без изолација:Брза идентификација на микробиолошки состав во примероци од животната средина.
●Висока резолуција: Во ниско-изобилни компоненти во еколошки примероци.
●Широко применлив: Разновидни студии за микробиолошка заедница.
●Сеопфатна биоинформатска анализа: Најновиот QIIME2 пакет (квантитативен увид во микробната екологија) со разновидни анализи во однос на базата на податоци, прибелешки, OTU/ASV.
●Широка експертиза: Со 150 илјади проекти за секвенционирање на засилувачи кои се спроведуваат годишно, BMKGENE носи повеќе од една деценија искуство, високо квалификуван тим за анализа, сеопфатна содржина и одлична поддршка по продажбата.
Спецификации за услуги
| Библиотека | Стратегија за секвенционирање | Препорачани податоци |
| Ампликон | Illumina PE250 | 50/100/300K ознаки (читани парови) |
Услуги барања
| Концентрација (ng/µL) | Вкупен износ (ng) | Волумен (µL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● Почва/тиња: 1-2гр
● Цревна содржина-животинско: 0,5-2гр
● Цревна содржина-инсект: 0,1-0,25гр
● Површина на растението (збогатен талог): 0,1-0,5гр
● Седимент збогатен со супа од ферментација): 0,1-0,5 g
● Измет (крупни животни): 0,5-2гр
● Измет (глувче): 3-5 зрна
● Течност за пулмонална алвеоларна лаважа: филтер хартија
● Вагинален брис: 5-6 брис
● Кожа/генитален брис/плунка/орално меко ткиво/фарингеален брис/ректален брис: 2-3 брис
● Површински микроорганизми: филтер-хартија
● Водно тело/воздух/биофилм: филтер-хартија
● Ендофити: 1-2гр
● Дентален плак: 0,5-1гр
Тек на услужна работа
Испорака на примероци
Изградба на библиотека
Секвенционирање
Анализа на податоци
Услуги по продажба
Ја вклучува следната анализа:
- Контрола на квалитетот на необработените податоци
- ОТУ кластерирање /Де-шум (ASV)
- ОТУ прибелешка
- Анализа на различноста на алфа: повеќекратни индекси, вклучувајќи ги Шенон, Симпсон и АКЕ.
- Анализа на бета разновидност
- Анализа меѓу групите
- Анализа на корелација: помеѓу факторите на животната средина и составот и различноста на OUT
- 16S функционален ген предвидување
Хистограм на таксономска дистрибуција
Топлинска карта за кластерирање на таксономски изобилство
Анализа на разновидност на алфа: крива на реткост
анализа на бета разновидност: NMDS
Интергрупна анализа: откритие на биомаркерот LEFSE
Истражете ги достигнувањата олеснети од услугите за секвенционирање на засилувачи на BMKGene со Illumina преку курирана колекција на публикации.
Донг, Ц. и сор. (2022) „Склопување, јадро микробиота и функција на ризосферата почва и микробиота на кората во Eucommia ulmoides“, Граници во микробиологијата, 13. doi: 10.3389/FMICB.2022.855317/F
Li, Y. и сор. (2023) „Трансплантација на синтетички бактериски конзорциуми за третман на бактериска вагиноза индуцирана од Gardnerella vaginalis кај глувци“, Microbiome, 11 (1), стр. 1-14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
Јанг, Ј., Фу, Ј. и Лиу, Х. (2022) „Микробиоми на воздушна прашина собрана за време на копнениот затворен биорегенеративен експеримент за одржување на живот „Лунарната палата 365““, Еколошки микробиоми, 17(1), стр. 1–20. doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8.
Јин, С. и сор. (2022) „Изобилство на функционални гени зависни од суровина поврзани со азотната трансформација контролирана загуба на азот при компостирање“, Технологија на биоресурси, 361, стр. 127678. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678.
