Ka whakamahia te kaiutuutu Mahere wera mo te tuhi mahere wera, ka taea te tātari, te whakarite me te kohinga matrix raraunga.Ka whakamahia te nuinga mo te wetewete huinga o te taumata whakapuaki ira i waenga i nga tauira rereke.
Te taapiri i nga mahi koiora ki nga raupapa i roto i te konae FASTA ma te whakahāngai i nga raupapa ki te paataka raraunga, tae atu ki te NR, KEGG, COG, SwissProt, TrMBL, KOG, Pfam.
Ko te BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) he hātepe me te kaupapa hei kimi i nga rohe e rite ana nga raupapa koiora. Ka whakatairitehia enei raupapa ki nga papaapapa raupapa me te tatau i te hiranga tauanga. Ko te BLAST e wha nga momo taputapu i runga i te momo raupapa: blastn, lastp, blastx me tblastn.