-
Nga kete taputapu
Ko te BMKCloud he papaaaao koiora e whakarato ana i te otinga kotahi-mutu mo nga kaupapa genomic, e tino whakaponohia ana e nga kairangahau i roto i nga momo waahi tae atu ki nga rongoa, ahuwhenua, taiao, me etahi atu. Kei te kaha a BMKCloud ki te whakarato i nga ratonga whakauru, pono me te whai hua tae atu ki nga papaaaata rangahau bioinformatic me nga taputapu. , rauemi rorohiko, pātengi raraunga tūmatanui, akoranga ipurangi bioinformtic, aha atu. He maha nga taputapu koiora e whakamahia ana e BMKCloud tae atu ki te tuhi ira, te whanaketanga. taputapu ira, ncRNA, mana kounga raraunga, huihuinga, whakahiatotanga, tangohanga raraunga, whakarereke, tatauranga, kaihanga ahua, tātari raupapa, aha atu.
-
De novo Bacterial Genome Assembly
Ka whakaratohia e matou he ratonga huihuinga ira huakita katoa, e kii ana kia 0 nga waahi. Ka taea tenei ma te whakauru i nga hangarau raupapa panui-roa, penei i te Nanopore me te PacBio mo te huihuinga me te raupapa panui poto me te Illumina mo te whakamana i te huihuinga me te whakatikatika hapa o nga panui ONT. Ka whakaratohia e ta maatau ratonga te rerenga mahi bioinformatic katoa mai i te huihuinga, nga korero mahi, me te tātari bioinformatic matatau, te whakatutuki i nga whaainga rangahau motuhake. Ma tenei ratonga ka taea te whakawhanaketanga o nga tohutoro tohutoro tika mo nga momo rangahau ira me te ira. Hei taapiri, ka noho hei turanga mo nga tono penei i te arotautanga riipene, te miihini ira, me te whanaketanga hangarau microbial, e whakarite ana i nga raraunga genomic pono me te kore-aputa he mea nui mo te ahu whakamua i nga tirohanga putaiao me te hangarau hangarau hou.
-
RNA iti
Ko nga RNA iti he momo RNA kore-waehere poto me te roa toharite o te 18-30 nt, tae atu ki te miRNA, siRNA me te piRNA. Ko enei RNA iti kua nui te korero kua uru ki roto i nga momo tukanga koiora penei i te whakahekenga o te mRNA, te aukati i te whakamaoritanga, te hanga heterochromatin, me etahi atu. Ko te turanga tātari raupapa he tātaritanga paerewa me te keri raraunga matatau. I runga i te turanga o nga raraunga RNA-seq, ka taea e te tātari paerewa te whakatutuki i te tohu me te matapae miRNA, te matapae ira whainga miRNA, te whakamaarama me te tātari korero. Ka taea e te tātaritanga matatau te rapu me te tangohanga miRNA, te whakaputa hoahoa Venn, te miRNA me te hanga whatunga ira ira.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
Ko te NGS-WGS he papaahanga tātari-a-ira-ira-ira katoa, i whakawhanakehia i runga i te turanga o nga wheako nui i roto i nga Hangarau Biomarker. Ma tenei papaahi ngawari ki te whakamahi ka taea te tuku tere i te rerenga mahi tātaritanga ma te whakarite noa i etahi tawhā taketake, e tika ana mo nga raraunga raupapa DNA i hangaia mai i te papaaho Illumina me te papa raupapa BGI. Ka tukuna tenei turanga ki runga i te tūmau rorohiko mahi teitei, e whakamana ana i te tātari raraunga tino pai i roto i te wa poto. E waatea ana te keri raraunga whaiaro i runga i te turanga o te tātaritanga paerewa, tae atu ki te patai ira ira, hoahoa tuatahi PCR, aha atu.
-
mRNA( Tohutoro)
Ko te Transcriptome te hononga i waenga i nga korero ira ira me te paati o te mahi koiora. Ko te whakaritenga taumata tuhi te mea tino nui me te tino ako i nga tikanga ture mo nga rauropi. Ka taea e te raupapa tuhinga te whakaraupapa i te tuhinga i nga wa katoa, i raro ranei i tetahi ahuatanga, me te whakatau tika ki te nucleotide kotahi. tauira tuhinga motuhake.
I tenei wa, kua whakamahia nuitia te hangarau raupapa tuhinga i roto i te agronomy, te rongoa me etahi atu mara rangahau, tae atu ki te ture whanaketanga kararehe me te tipu, te urutau taiao, te taunekeneke aukati, te waahi ira, te whanaketanga momo ira me te mate pukupuku me te mate ira.
-
Metagenomics (NGS)
Ko tenei papahanga tātari i hangaia mo te tātari raraunga metagenomic shotgun i runga i nga tau o te wheako. Kei roto ko te rerengamahi whakauru kei roto i nga momo tātaritanga metagenomics e hiahiatia ana tae atu ki te tukatuka raraunga, nga rangahau taumata-momo, nga rangahau taumata-mahinga ira, te whakakao metagenome, me etahi atu. , te whakatakotoranga tawhā, te whakaputa ahua whaiaro, etc.
-
LncRNA
Ko nga RNA kore-waehere roa (lncRNA) he momo tuhi me te roa atu i te 200 nt, kaore e taea te tohu i nga pūmua. Ko nga taunakitanga whakahiato e whakaatu ana ko te nuinga o nga lncRNA ka tino mahi. Ko nga hangarau raupapa teitei me nga taputapu tātari bioinformatic e whakamana ana i a tatou ki te whakaatu i nga raupapa lncRNA me nga korero tuunga kia pai ake, ka arahi i a tatou ki te rapu i nga lncRNA me nga mahi tino nui. Kei te whakahīhī a BMKCloud ki te whakarato ki o taatau kaihoko te papahanga tātari raupapa lncRNA ki te whakatutuki i te tātaritanga lncRNA tere, pono me te ngawari.
-
GWAS
Ko te rangahau hononga ira-whanui (GWAS) e whai ana ki te tautuhi i nga momo ira (genotype) e hono ana ki nga ahuatanga motuhake (phenotype). Ka tirotirohia e nga rangahau a GWA nga tohu ira e whakawhiti ana i te ira tangata katoa me te matapae i nga hononga tohu-ira ma te tātari tauanga i te taumata taupori. Ka kitea pea e te resequencing-ira-ira katoa nga momo ira katoa. Ma te hono me nga raraunga tohu, ka taea te tukatuka GWAS ki te tautuhi i nga SNP e pa ana ki te tohu tohu, nga QTL me nga ira kaitono, e kaha tautoko ana i te whakatipu kararehe/tipu hou. Ko te SLAF he rautaki whakaraupapa ira ira tangata ngawari, e kitea ana nga tohu tohatoha ira-whanui, SNP. Ko enei SNP, hei tohu tohu ira rapoi, ka taea te tukatuka mo nga rangahau hononga me nga ahuatanga kua tohua. He rautaki whai hua ki te tautuhi i nga ahuatanga uaua e pa ana ki nga rereketanga ira.
-
Nanopore Ko nga tuhinga roa-katoa
Ko nga momo ahua rereke me te rereke rereke i roto i nga rauropi he tikanga ira nui hei whakahaere i te whakaputanga ira me te kanorau pūmua. Ko te tautuhi tika o nga hanganga tuhinga te putake mo te rangahau hohonu o nga tauira ture whakaputa ira. Ko te papa raupapa raupapa Nanopore kua angitu te kawe mai i te rangahau whakawhiti ki te taumata-isoform. I hoahoatia tenei papahanga tātari hei tātari i nga raraunga RNA-Seq i hangaia i runga i te papaapapa Nanopore i runga i te turanga o te tohutoro tohutoro, e tutuki ana i nga tātaritanga kounga me te ine i roto i te taumata ira me te taumata tuhinga.
-
porowhita-RNA
Ko te RNA porowhita(circRNA) he momo RNA kore-waehere, ka kitea tata nei ka whai waahi nui ki roto i nga kupenga ture e whai waahi ana ki te whakawhanake, te aukati i te taiao, me era atu. He rereke mai i nga ngota ngota RNA raina, hei tauira mRNA, lncRNA, 3' me te 5' ka honoa nga pito o te circRNA ki te hanga i te hanganga porowhita, e ora ai i te nakunaku o te exonuclease me te noho pumau atu i te nuinga o te RNA raina. Kua kitea he rereke nga mahi a CircRNA ki te whakahaere i te whakaaturanga ira. Ka taea e CircRNA te mahi hei ceRNA, e herea ana te miRNA whakataetae, e kiia nei ko te hautai miRNA. Ka whakamanahia e te papahanga tātari raupapa a CircRNA te hanganga circRNA me te tātari korero, te matapae whaainga me te tātari tahi me etahi atu momo ngota ngota RNA
-
BSA
Ko te tüäpapa o te tüäpapa o te tüäpapa o te tüäpapa o te tüäpapa o te tätari paerewa kotahi-taahiraa me te tätari matatau me te whakatakotoranga tawhā kua whakaritea. Ko te BSA he tikanga e whakamahia ana hei tautuhi tere i nga tohu tohu ira e pa ana. Ko te rerengamahi matua o te BSA kei roto: 1. te kowhiri i nga roopu e rua o nga tangata e tino whakahē ana nga tohu tohu; 2. te whakakotahi i te DNA, te RNA, te SLAF-seq ranei (I hangaia e te Biomarker) o nga tangata katoa kia rua te nuinga o te DNA; 3. te tautuhi i nga raupapa rereke ki te ira tohutoro, i waenga ranei, 4. te matapae i nga rohe hono a te kaitono ma te ED me te SNP-index algorithm; 5. Te tātari mahi me te whakarangatira i nga ira i roto i nga rohe kaitono, me era atu. Kei te waatea ano te keri matatau i roto i nga raraunga tae atu ki te tirotiro tohu ira me te hoahoa tuatahi.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) papaaapapa kua whakawhanakehia me nga tau o te wheako i roto i te rangahau kaupapa kanorau moroiti, kei roto he tātari taketake me te tātaritanga whaiaro: ko te tātaritanga taketake e hipoki ana i nga ihirangi tātari auraki o te rangahau moroiti o naianei, he taonga me te matawhānui te ihirangi tātari, a ka whakaatuhia nga hua tātaritanga ki te ahua o nga ripoata kaupapa; He kanorau te ihirangi o te tātaritanga whaiaro. Ka taea te kowhiri i nga tauira ka taea te whakarite ngawari i runga i te purongo tātari taketake me te kaupapa rangahau, ki te whakatutuki i nga whakaritenga whaiaro. Pūnaha whakahaere Windows, ngawari me te tere.
-
Ira Kunenga
Ko te Evolutionary Genetics he ratonga raupapa matawhānui i hangaia hei tuku i te whakamaaramatanga o te kukuwhatanga i roto i te roopu nui o nga tangata takitahi, i runga i nga rereketanga ira, tae atu ki nga SNP, InDels, SVs, me CNVs. Kei roto i tenei ratonga nga tātaritanga matua katoa e tika ana hei whakamarama i nga huringa kunenga me nga ahuatanga ira o te taupori, tae atu ki nga aromatawai o te hanganga taupori, te kanorau ira, me nga hononga phylogenetic. I tua atu, ka uru ki nga rangahau mo te rerenga ira, ka taea te whakatau tata mo te rahinga taupori whai hua me te wa rerekee. Ko nga rangahau ira kukuwhatanga ka puta he tirohanga nui ki te takenga mai me te urutaunga o nga momo.
I BMKGENE, e rua nga huarahi ka tukuna e matou mo te whakahaere rangahau ira kunenga ki runga i nga taupori nui: te whakamahi i te raupapa ira-ira katoa (WGS) me te whiriwhiri ranei mo te tikanga whakaheke ira tohu tohu, ko te Waahanga Whakanui-a-whare i hangaia i roto i te whare. Ahakoa e pai ana a WGS ki nga momo ira iti ake, ka puta te SLAF hei huarahi utu-utu mo te ako i nga taupori nui me nga momo ira roa, me te whakaiti i nga utu raupapa.
