
mRNA-seq (NGS) me te ira tohutoro
Ko te RNA-seq he taputapu paerewa puta noa i te oranga me te putaiao hua, e hono ana i te aputa i waenga i nga ira me nga proteomes. Ko tona kaha kei te rapu tuhinga hou me te ine i o raatau korero i roto i te whakamatautau kotahi. E whakamahia nuitia ana mo nga rangahau whakawhiti kupu whakatairite, he whakamarama i nga ira e pa ana ki nga ahuatanga rereke, ki nga momo tohu ranei, penei i te whakatairite i nga mutants ki nga momo mohoao, te whakaatu whakaaturanga ira ranei i raro i nga tikanga motuhake. Ko te BMKCloud mRNA(Reference) APP e whakauru ana i te inenga korero, te tātari korero rerekee (DEG), me te tātari hanganga raupapa ki roto i te pipeline bioinformatics mRNA-seq(NGS) me te whakakotahi i nga kaha o te raupaparorohiko rite, te whakarite i te waatea me te ngawari ki te kaiwhakamahi. Ka taea e nga kaiwhakamahi te tuku i o raatau raraunga RNA-seq ki te kapua, kei reira te App e tuku ana i te otinga tātaritanga bioinformatic matawhānui, kotahi-mutu. I tua atu, ka aro nui ki te wheako o nga kaihoko, e tuku ana i nga mahi whakawhaiaro ki nga hiahia motuhake o nga kaiwhakamahi. Ka taea e nga kaiwhakamahi te whakarite tawhā me te tuku i te miihana pipeline ma ratou ano, tirohia te purongo tauwhitiwhiti, tirohia nga raraunga/whakaahua me te whakaoti i te keri raraunga, penei: te kowhiringa ira ira, te whakahiato mahi, te hoahoa, me era atu.
Pūhara:Ilumina, MGI
Rautaki:RNA-Seq
Tahora: Paried, clean-data.
Momo whare pukapuka:fr-unstranded, fr-firststrand or fr-secondstrand
Te roa o te panui:150 bp
Momo kōnae:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz or *.fq.gz. Ko te punaha katakirua aunoa i nga konae .fastq kia rite ki o raatau ingoa konae,hei tauira *_1.fastq takirua ki *._2.fastq.
Te maha o nga tauira:Karekau he here mo te namao nga tauira, engari ka piki ake te wa tātari hei te maha oka tipu nga tauira.
Raraunga Raraunga Manakohia:6G mo ia tauira