Nanopore Katoa-roa te tuhinga tuhi

He tikanga kaha te whakamaoritanga whakawhiti o te Nanopore mo te whakaraupapa i nga cDNA roa-katoa, te tautuhi tika me te ine i nga momo tuhinga tuhi. Ko te BMKCloud Nanopore Full-Length Transcriptome Pipeline i hangaia hei tātari i nga raraunga RNA-Seq i hangaia i runga i te papaapapa Nanopore ki tetahi tohutoro tohutoro pai-kounga teitei, e whakarato ana i te tātaritanga kounga me te ine i te ira me te taumata tuhinga. Whai muri i te mana o te kounga, ka whiwhihia nga raupapa kore-chimeric (FLNC) roa, ka mapihia nga raupapa whakaaetanga ki te ira tohutoro hei tango i nga tuhinga taapiri. Mai i tenei huinga tuhinga, ka ine te kii, ka tohuhia nga ira rerekee me nga tuhinga tuhi, ka tohuhia nga mahi. Kei roto ano hoki i te paipa te tātari polyadenylation (APA), te tātaritanga splicing rereke, te tātaritanga raupapa ngawari (SSR), te matapae o te lncRNA me nga whaainga e rite ana, te matapae o nga raupapa tohu (CDS), te tātari whanau ira, te tātari tauwehe whakawhiti, te matapae o nga ira pukapuka. me te tuhipoka mahi o nga tuhinga.