mRNA-seq (NGS) – De novo

Ko te raupapa mRNA ka taea te whakaatu i nga tuhinga katoa o te mRNA i roto i nga pūtau i raro i nga tikanga motuhake, a he hangarau e whakamahia nuitia ana i roto i nga waahanga rangahau. I hangaia te BMKCloud De novo mRNA-seq pipeline ki te tātari i nga whare pukapuka raupapa whakarangatira poly-A ina karekau he momo tohutoro e waatea ana. Ka timata te paipa ki te whakahaere kounga, ka whai maino novote huinga tuhinga me te kowhiringa huinga unigene. Ko te tātaritanga hanganga unigene e matapae ana i te raupapa tohu (CDS) me te tukurua raupapa ngawari (SSR). I muri mai, ka kitea e te tātari korero rerekee nga ira rerekee (DEGs) i waenga i nga ahuatanga kua whakamatauria, ka whai i nga korero mahi me te whakarangatira i nga DEG hei tango i nga tirohanga koiora.