Roa Kore-waehere Whakaraupapa-Illumina
Painga Ratonga
●Te tātari tahi o te mRNA me te lncRNA: na roto i te whakakotahi i te inenga o nga tuhinga mRNA me te ako o te lncRNA me o raatau whaainga, ka taea te tiki tirohanga hohonu o te tikanga whakahaere i raro i te urupare pūkoro.
●Tohunga Nui: He maha nga wheako ka kawea mai e ta maatau roopu ki ia kaupapa, me te rekoata mo te tukatuka neke atu i te 23,000 tauira i te BMK mo nga momo tauira kanorau me nga kaupapa lncRNA.
●Mana Mana Kounga: Ka whakatinanahia e matou nga tohu whakahaere matua puta noa i nga waahanga katoa, mai i te tauira me te whakarite whare pukapuka ki te raupapatanga me te bioinformatics. Ma tenei aro turuki e whakarite te tukunga o nga hua o te kounga teitei.
●Tautoko i muri i te Hokonga: Ko ta matou herenga ka toro atu ki tua atu i te otinga kaupapa me te 3 marama i muri i te hokonga ratonga. I roto i tenei wa, ka tukuna e matou he kaupapa whai ake, he awhina rapurongoa, me nga huihuinga Q&A hei whakatika i nga patai e pa ana ki nga hua.
Nga Whakaritenga Tauira me te Tukunga
| Whare Pukapuka | Paerewa | Raraunga e taunaki ana | Raraunga QC |
| rRNA kua pau te whare pukapuka aronga | Ilumina PE150 | 10-16 Gb | Q30≥85% |
Nucleotides:
| Conc.(ng/μl) | Rahi (μg) | Maamaa | Te tapatahi |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 He iti, karekau he pūmua, he poke DNA ranei e whakaatuhia ana i runga i te gel. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; he iti, he kore ranei te taumata teitei |
● Nga tipu:
Putake, Kakau, Petal ranei: 450 mg
Rau, Kakano ranei: 300 mg
Hua: 1.2 g
● Kararehe:
Te Manawa, Te Wokao ranei: 450 mg
Viscera roro ranei: 240 mg
Te uaua: 600 mg
Koiwi, makawe, kiri ranei: 1.5g
● Angahuri:
Nga pepeke: 9g
Crustacea: 450 mg
● Te toto katoa:2 ngongo
● Pūtau: 106 pūtau
● Serum me te Plasma: 6 mL
Tukunga Tauira Manakohia
Ipu: 2 ml ngongo centrifuge (Kāore i te tūtohutia te konumohe tine)
Tauira tapanga: Rōpū+whakaritea tauira A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Tukunga:
1. Tio-maroke: Me kiki nga tauira ki roto i nga peeke ka tanumia ki te huka-maroke.
2. Nga ngongo RNAstable: Ka taea te whakamaroke i nga tauira RNA ki te ngongo whakapumau RNA(hei tauira RNAstable®) ka tukuna ki te pāmahana rūma.
Te Rerenga Mahi Ratonga
Hoahoa whakamatautau
Te tuku tauira
tangohanga RNA
Te hanga whare pukapuka
Whakaraupapa
Te tātari raraunga
Nga ratonga muri-hoko
Bioinformatics
Te tātari ira ira rereke (DEGs).
Te inenga o te whakahuatanga lncRNA - te kohinga
Te whakarangatira i nga ira whainga lncRNA
Te tātari tūnga mRNA me te lncRNA - Circos plot (ko te porowhita waenga ko te mRNA me te porowhita o roto ko te lncRNA)
Te torotoro i nga ahunga whakamua i whakahaerea e nga ratonga whakatairite lncRNA a BMKGene na roto i te kohinga whakaputanga.
Ji, H. et al. (2020) 'Te tautuhi, te matapae mahi, me te manatoko lncRNA matua o nga lncRNA e pa ana ki te ahotea makariri i roto i te ate kiore', Pūrongo Putaiao 2020 10:1, 10(1), wharangi 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) 'Whakakitea te Taatari Whakawhitinga Whakakotahi i te Tikanga Whakamate mo te Riu Carp Common CyHV-3-Resistant', Frontiers in Immunology, 12, wh. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ et al. (2022) 'Multi-Omics Integration-Based Prioritization of Cometing Endogenous RNA Regulation Networks in Small Cell Lung Cancer: Nga Ahuatanga Molecular and Drug Candidates', Frontiers in Oncology, 12, wh. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) 'Te wetewete ira o te kupenga whakakoi ira i raro i te whakaahuatanga i Populus', Plant Biotechnology Journal, 18(4), wh. 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) 'He Whatunga Whakaritea Ao mo te Whakaaturanga Ira Dysregulated me te Waitohu Metabolic Abnormal i roto i nga Pūtau Immune i te Microenvironment of Graves' Disease and Hashimoto's Thyroiditis', Frontiers in Immunology, 13, p. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
