Hi-C i runga i te taunekeneke chromatin
Āhuatanga Ratonga
● Te haerere i Idquina Novaseq me Pe150.
● Me tono te ratonga ki nga tauira kiko, kaua ki te waikawa karihi, ki te hono atu me te momaldehyde me te tiaki i nga taunekeneke DNA-pūmua.
● Ko te whakamatautau hi-c ko te aukati me te whakamutu i nga pito ka piri ki te biotin, ka whai i te porowhita o nga hua ka mutu i te wa e penapena ana i nga taunekeneke. Ka kumea te DNA me nga beads staptavidin me te purea mo te whakaritenga whare pukapuka o muri.
Painga ratonga
●Hoahoa Whakahoahoa Enzyme: Ki te whakarite i te kaha hi-C ki nga momo rereke me te 93% takirua taunekeneke whaitake.
●Nga rekoata o te maaramatanga me te whakaputa korero:He wheako nui a Bmkgene ki te> 2000 nga kaupapa taapiri hi-c mai i nga momo 800 rereke me nga papaa maha. Neke atu i te 100 nga keehi kua whakaputaina me te paanga o te whaainga o te 900.
●Rōpū Motuhake o te Bionfinformatics tino mohio:Ki nga patent-whare me nga raupaparorohiko raupaparorohiko mo nga whakamatautau hi-c me te tātari raraunga me te punaha raraunga-a-tinana.
●Tautoko Kaainga-Hokohoko:Ko ta tatou pumau ki te whakaoti i te otinga o te kaupapa me te waa 3-marama i muri i te waa. I roto i tenei waa, ka whakaekea e maatau te kaupapa whai ake, e pa ana ki te awhina, me te Q & he huihuinga hei whakatika i nga paatai e pa ana ki nga hua.
●Whakaputa Rangahau: Ka whakamahia e matou he maha nga raraunga mo te whakaputa i nga ira me nga rereketanga kua tohua me te mahi i te tātaritanga whai hua, te whakarato whakaaro ki nga kaupapa rangahau maha.
Whakariterite Ratonga
| Whare pukapuka | Rautaki rautaki | Putanga raraunga kua taunakitia | Hi-C Whakataunga Tohu |
| Hi-C Whare Pukapuka | Illumina P150 | Chromatin boop: 150x Tad: 50x | Chromatin boop: 10kb Tad: 40kb |
Nga tono a te Ratonga
| Momo tauira | Moni e hiahiatia ana |
| Te kiko kararehe | ≥2g |
| Toto katoa | ≥2mL |
| Hao | ≥1g |
| Tipu- te kiko o te kiko | 1g / Alliquot, 2-4 aliquotes i tūtohutia |
| Ko nga pūtau ahurea | ≥1x107 |
Kei roto i te tātaritanga e whai ake nei:
● Raraunga Raraunga QC;
● Ma te mahere me te whare pukapuka hi-c: takirua whakahoahoa me nga kaiwhakamaori deciction (IDE);
● Ko te whakahoahoa honohono-whanui e whakaatu ana: CIS / Trancesis Tractions me Hi-C Mahere Whakahoahoa;
● Te tātaritanga o te tohatoha A / B;
● Te tautuhi i nga tads me nga koropiko chromatin;
● Te tātari rereketanga mo nga waahanga hanganga o Chromatin 3D i waenga i nga tauira me nga tohu tohu e rite ana ki nga ira ira.
Ko te CIS me te tohatoha tohatoha
Te Haumaru o nga Tauhokohoko Chromosomal i waenga i nga tauira
Te tohatoha whanui-whanui o te waahanga / B
Te tohatoha whanui-whanui o nga koropiko chromatin
Tuhinga o mua
Tirohia te ahunga whakamua rangahau i whakahaeretia e te ratonga taapiri a Bmkgene's hi-C ma te kohinga kohinga.
Meng, T. et al. (2021) 'Ko te tātaritanga maha-Oricsic whakarite te tohu i te CA2 hei whaainga hou mo te Chordoma',Neuro-oncology23, 23 (10), PP. 1709-1722. doi: 10.1093 / Neuonc / Noab156.
XU, L. et al. (2021) 'Te Whakakoretanga 3D Whakakore me te whakariterite o Gentogenes i roto i te pathogenesis o NAFLD na te hi-C, Nanoperore, me te RNA SEQUENGING',ACTA Pharmaceutica SinIca B11, 11 (10), PP. 3150-3164. doi: 10.1016 / J.apsb.2021.03.022.
