Genetic Generics
Painga ratonga
Takagi et al.,Te Wehewehenga Tae, 2013
●Tātaritanga BioFMomatic matawhānui:Ko te whakahoahoa i te whakatauranga irava, e whakaatu ana i te mana o te whakatipuranga, me te whakaatu i te whanaungatanga phylogetnetic pono i waenga i nga momo me te awe a te whanaketanga
●Te tātaritanga whakatauranga: penei i te whakatau tata i te waa rereke me te tere i runga i nga rereketanga i te nuceanotide me te waikawa amino waikawa.
●Nga mahi a te tohungatanga me nga rekoata whakaputanga: Kua whakaemihia e Bmkgene he wheako nui i roto i nga kaupapa taupori me te whakatipuranga mo te 15 tau, e pa ana ki nga mano o nga momo momo, me te tipu o te tipu o te taumata, tipu o te umanga hauota, etc.
● Ko te roopu Bionfinformacs tino mohio me te huringa tātari poto: Ma te wheako nui i roto i te tātaritanga tino matatau, ka tukuna e te roopu a BMKGENE te tarai i te waa tere tere.
● Tautoko Kaainga-Hokohoko:Ko ta tatou pumau ki te whakaoti i te otinga o te kaupapa me te waa 3-marama i muri i te waa. I roto i tenei waa, ka whakaekea e maatau te kaupapa whai ake, e pa ana ki te awhina, me te Q & he huihuinga hei whakatika i nga paatai e pa ana ki nga hua.
Nga whakaritenga ratonga me nga whakaritenga
| Te momo o te rahi | Taumata taupori e taunakitia ana | Rautaki rautaki | Whakaritenga Nuku |
| Ko te katoa o nga gionie katoa | ≥ 30 Ko nga tangata takitahi, me nga takitahi 10 takitahi mai i ia subgroup
| 10x | Te kukū: ≥ 1 ng / μl Te Tapeke AUKA 30NT Whāiti, kaore ranei he ngoikore, he paitini ranei |
| Whakapaipai-Maatauranga Motuhake (Slaf) | Te hohonu: 10x Te maha o nga tūtohu: <400 MB: Ka tūtohutia nga Wgs <1GB: 100k Tags 1GB > 2GB: 300K Tags Tags 500K Tags | Te kukū ≥ 5 ng / μl Tapeke ≥ 80 ng Nanodrop Od260 / 280 = 1.6-2.5 Agarose Gel: Kaore ranei he iti, he ngoikore ranei
|
Rere mahi ratonga
Hoahoa Whakamatau
Tauira tauira
Hanganga Whare Pukapuka
Tuhinga o mua
Tātaritanga Raraunga
I muri i nga ratonga hoko
Kei roto i te Ratonga te tātaritanga o te taupori taupori (PCA, PCA, mahere taupori, te rereketanga o te taupori, me te tangohanga o te taupori. Ka taea hoki e te ratonga te whakauru i te tātaritanga ritenga (hei tauira, te waa rereke, te rere a ira).
*Ko nga hua o Demo i whakaaturia i konei ko nga mea katoa i whakaputaina me BMKGGENE
1.Evolution tātari kei roto i te hanga o te rakau phylognetic, te hanganga taupori me te pcA i runga i nga rereketanga ira.
Ko te rakau phylogenetic e tohu ana i nga hononga taakete me te whanaketanga i waenga i nga momo me nga tupuna noa.
Ko te PCA e whai ana ki te tiro i te tata ki waenga i nga taupori iti.
Ko te hanganga taupori e whakaatu ana i te aroaro o te taupori iti motuhake e pa ana ki nga tikanga o te nuinga o te waa.
Chen, et. al.,Pū pupū2020
2.selective swap
Ko te huringa whiriwhiri e pa ana ki tetahi mahinga e tohua ana me te maha o nga waahi nehu kua honoa, ka whakahekehia nga waahi kaore i whakatauhia, ka whakahekehia te rereketanga o te rohe.
Ko te kitenga o Genome i runga i nga rohe o te taupū e tarai ana i te taupori taupori (π, FST, Tajima's D) o nga SNPs katoa (100 KB).
Te rereketanga o te Nuku (π)
Tajima's D
Tohu Whakatika (FST)
Wu, et. al.,Tipu tipu, 2018
3.gene rere
Wu, et. al.,Tipu tipu, 2018
4.Whakaahua hītori
Zhang, et. al.,Taiao taiao & whanaketanga2021
5.Whakarongo i te waa
Zhang, et. al.,Taiao taiao & whanaketanga2021
Tirohia te Whakauru i nga Whakauru i Whakatutuhia e nga Ratonga Genestics Generics a Bmkgene na roto i te kohinga kohinga:
Hassanyar, AK et al. (2023) 'Te kitenga o te tohu ngota me nga kaitono i runga i te whakaeke huaketo saybrood i te torongū o te Carana Carana e te GeomeTuhinga o mua, 24 (7). DOI: 10.3390 / IJMS24076238.
Chai, J. ET al. (2022) 'Te kitea o te mohoao, te ira tangata hou o te salamander Hainamana ka waihanga i nga whai waahi penapena hou',Rangahau Toi2022, Vol. 43, Tukuna 3, Whārangi: 469-480, 43 (3), PP. 469-480. doi: 10.24272 / J.issn.2095-8137.2022.101.
Han, M. et al. (2022) Ko te tauira phylogeographical me te hitori o te taupori o te iwi taketake o te taketake o te taketake o te taketake o te tangata taketake o te taketake o te taketake o te tangata taketake o te taketake o te iwi taketake o te taketake.Nga Kaipupuri i te Pūtaiao Whakataetae13, wh. 882601. DOI: 10.3389 / FPLS.2022.882601 / BIBTEX.
Wang, J. Et al. (2022) Ko nga tirohanga geromic ki roto i te whanaketanga o Lowen mai i te huihuinga o te Gemosome-taumata o te ao me nga kohinga taupori o Lowen ',Rangahau Rangahau, 9. DOI: 10.1093 / HR / UHAC021.
