DNBSEQ nga whare pukapuka kua oti te hanga
Ngā āhuatanga
●Pūhara:MGI-DNBSEQ-T7
●Aratau raupapa:PE150
●Te whakawhiti i nga whare pukapuka Illumina kiMGI:te whakaahei i te raupapatanga o nga pukapuka raraunga teitei i te utu iti.
●Te whakahaere kounga o nga whare pukapuka i mua i te raupapa.
●Te raupapa raraunga QC me te tuku:te tuku purongo QC me nga raraunga mata i roto i te whakatakotoranga fastq i muri i te whakakore me te tātari i nga panui Q30.
Nga painga
●Te maha o nga ratonga Whakaraupapa:ka taea e te kaihoko te whiriwhiri ki te raupapa ma te huarahi, te nui ranei o nga raraunga.
●Putanga raraunga teitei:1500 Gb/raina
●Te tukunga o te ripoata QC raupapa:me nga inenga kounga, te tika o nga raraunga me te mahinga katoa o te kaupapa raupapa.
●Te tukanga raupapa pakeke:me te wa poto hurihuri.
●Mana Mana Kounga: ka whakatinanahia e matou nga whakaritenga a QC hei whakapumau i nga hua o te kounga teitei.
Nga Whakaritenga Tauira
| Raraunga Raraunga (X) | Kukū (qPCR/nM) | Rōrahi | |
| Ara Wahi
| X ≤ 10 Gb | ≥1nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
| Ara Kotahi | Per Lane | ≥ 1.5 nM / puna puna | ≥ 25 μl / puna puna |
I tua atu i te kukū me te tapeke moni, ka hiahiatia ano he tauira tihi pai.
Tuhipoka: Ko te raupapatanga o nga whare pukapuka kanorau iti e tika ana kia uru mai a PhiX kia pai ai te waea turanga.
Ka tūtohu mātou kia tukuna he whare pukapuka kua whakahiatohia hei tauira. Mena ka hiahia koe ki te BMKGENE ki te whakahaere i te kohinga whare pukapuka, tirohia te
Ko nga whakaritenga o te whare pukapuka mo te raupapa waahanga waahanga.
Rahi Whare Pukapuka (Mapi tihi)
Me noho te tihi matua i roto i te 300-450 bp.
Kia kotahi te tihi matua o nga whare pukapuka, kaore he poke urutau, kaua hoki he dimer tuatahi.
Rerengamahi Ratonga
Pūrongo QC Whare Pukapuka
Ka tukuna he purongo mo te kounga o te whare pukapuka i mua i te raupapatanga, te aromatawai i te nui o te whare pukapuka, me te wehewehenga.
Te raupapa QC ripoata
Ripanga 1. Nga tatauranga mo te raupapa raraunga.
| Tauira ID | BMKID | Panui mata | Raraunga Raw (bp) | Nga panui ma (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Whakaahua 1. Te tohatoha kounga i runga i nga panui i ia tauira
Whakaahua 2. Te tohatoha ihirangi turanga
Whakaahua 3. Te tohatoha o nga korero panui i roto i nga raraunga raupapa
