IDEMINA i mua i nga whare pukapuka
Ngakau
●Ngā Tract:Illumina Novaseq 6000 me Novaseq x Plus
●Tauira Huringa:Pe150 me Pe250
●Te whakahaere kounga o nga Whare Pukapuka i mua i te Tirohanga
●Te raupaparorohiko raraunga QC me te tuku:Te Tukunga o te Ripoata QC me nga Raraunga Raw i roto i te hōputu tere i muri i te whakaheke me te tātari Q30
Painga ratonga
●Tuhinga o mua.Ka whiriwhiri pea te kaihoko ki te raupapa ma te ara, te rere o te pūtau, te nui ranei o nga raraunga e hiahiatia ana (te waahanga o te ara.
●He nui te wheako mo te Pūtea Sequnoning Illumina:me nga mano o nga kaupapa katia me nga momo momo.
●Te tuku i te ripoata a Squanic:Ki nga tohu kounga, ka tika te raraunga me te katoa o te mahinga o te kaupapa aho.
●He mahinga taapiri pakeke:me te wa poto hurihuri.
●Te mana whakahaere kounga: Ka whakatinanahia e matou nga whakaritenga QC hei whakapumau i te tuku i nga hua o te kounga kairangi.
Tauira Tauira
| Tūranga | Pūtau rere | Aratau Tae | Aronui | Te whakatau i te putanga |
| Novaseq x | 10b (8 lanes) | Pe150 | Kotahi noa Taonga | 375GB / ara |
| 25b (8 lanes) | Pe150 | Kotahi noa Taonga | 1000 GB / Lane | |
| Novaseq 6000 | Ko te pūtau rere SP (2 nga huarahi) | Pe250 | Pūtau rere Kotahi noa Taonga | 325-400 m panui / ara |
| S4 rere pūtau (4 nga ara) | Pe150 | Pūtau rere Kotahi noa Taonga | ~ 800 GB / ara |
Tauira Tauira
| Moni raraunga (x) | Te kukū (QPCR / NM) | Pukapuka | |
| He waahanga taapiri
| X ≤ 10 gb | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
| 10 GB <x ≤ 50 gb | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
| 50 GB <x ≤ 100 gb | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
| X> 100 gb | ≥ 4 nm | ≥ 25 μl | |
| He ara nui | Ia ara | ≥ 1.5 NM / Whare Pukapuka | ≥ 25 μl / whare pukapuka |
I tua atu i te kukume me te katoa, ka hiahiatia hoki he tauira tihi tika.
FAKATOKANGA: Ko te ara e haere ana i nga wharepukapuka Diversity iti e hiahia ana ki a Phix Spike-roto hei whakarite i te karanga pakari.
Ka tūtohu mātou ki te tuku i nga whare pukapuka i mua i te waa hei tauira. Mena ka hiahia koe ki te BMKGENE ki te mahi i te kaukau whare pukapuka, tena tirohia
Ko nga whakaritenga o te whare pukapuka mo te waahanga taapiri.
Rahi Pukapuka (Mahere Peak)
Ko te tihi matua kei roto i te 300-450 BP.
Me whai nga wharepukapuka tetahi tihi matua, kaore he paitini hiko, kaore he kaikiri tuatahi.
Tena koa toro atu ki a maatau mena kaore e tutuki i o tauira nga whakaritenga o nga rauemi.
Ratonga Mahi Ratonga
Te mana o te whare pukapuka
Tuhinga o mua
Te mana o te raraunga
Te tuku kaupapa
Pūrongo QC Pūrongo
He ripoata mo te kounga o te whare pukapuka i mua i te huringa, te aromatawai i te rahinga o te whare pukapuka, me te wehenga.
Te Ripoata QC
Ripanga 1. Tatauranga i runga i nga raraunga taapiri.
| Tauira ID | Pērā | Panui mata | Raraunga Raw (BP) | Pānuitia Maha (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Whakaahua 1. Te tohatoha kounga i te taha o nga panui i ia tauira
Whakaahua 2. Te tohatoha ihirangi
Whakaahua 3. Te tohatoha o nga tuhinga i roto i nga raraunga taapiri
