Te roa o te waahanga MRNA SEQUENTING -PACBIO
Ngakau
● Ko te whakahiato CDNA mai i te poly - he MRNA ka whai mai i te whakareri pukapuka
● Te huringa i roto i te aratau CCS, te whakaputa i te hifi
● Te huringa o nga tuhinga roa-roa
● Ko te tātari kaore e tika ana ki te tohutoro tohutoro; Heoi, ka taea pea te mahi
● Ko te tātaritanga bionfinformlic te whakahohe i nga tuhinga o te whakawhiti i te Lncrna, nga huihuinga ira, te poly-piri, me te hanganga ira
Painga ratonga
●Te tika o te tika: Ka panui a Hifi me te tika> 99.9% (Q30), he rite ki nga Ngs
● Te tātari whaikorero rereke: Ko te huringa o nga tuhinga katoa ka taea e te tautuhi isoform me te ahuatanga
●Tohungatanga pūkenga nui: Ma te rekoata tere o te whakaoti i te 1100 Pacbio roa nga kaupapa whakawhiti me te tukatuka i nga tauira 2300, ka whai wheako to taatau kapa ki nga kaupapa katoa.
●Tautoko Kaainga-Hoko: Ko ta maatau taunga kei tua atu o te whakaotinga kaupapa me te waa 3-marama i muri i te waa. I roto i tenei waa, ka whakaekea e maatau te kaupapa whai ake, e pa ana ki te awhina, me te Q & he huihuinga hei whakatika i nga paatai e pa ana ki nga hua.
Tauira tauira me te tuku
| Whare pukapuka | Rautaki rautaki | Ko nga raraunga i taunakitia | Te mana whakahaere |
| I whakanuia a Polya MRNA CCS | Pacbio Sequel II Pacbio Revio | 20/40 gb 5/10 m ccs | Q30≥85% |
Tauira Tauira:
Nga Nuku:
● tipu:
Root, Stem or Petal: 450 mg
Rau, purapura ranei: 300 mg
Hua: 1.2 g
● kararehe:
Te ngakau, te whekau ranei: 300 mg
Viscera, roro ranei: 240 mg
Uaua: 450 mg
Nga wheua, te makawe, kiri ranei: 1g
● Arthropods:
Ngā pepeke: 6g
Crustacea: 300 mg
● Katoa te toto: 1 ngongo
● pūtau: 106 pūtau
| Am. (Ng / μl) | Moni (μg) | Mā | Pono |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | Od260 / 280 = 1.7-2.5 Od260 / 230 = 0.5-2.5 Whāiti, kaore ranei he pūmua, te paitini ranei i whakaatuhia i runga i te gel. | Mo nga tipu: Rin≥7.5; Mo nga kararehe: Rin≥8.0; 5.0≥ 28s / 18s≥1.0; whāiti, kāhore rānei e teitei te teitei |
Te tuku tauira tohutohu
Ipu: 2 ml centrifuge ngongo (kaore i te tūtohutia)
Tapanga Tauira: Rōpū + Whakakapihia hei tauira A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Tukunga:
1
2
Rere mahi ratonga
Hoahoa Whakamatau
Tauira tauira
RNA Afetetanga RNA
Hanganga Whare Pukapuka
Tuhinga o mua
Tātaritanga Raraunga
I muri i nga ratonga hoko
Kei roto i te tātaritanga e whai ake nei:
● Ko te Mana Tohu Raraunga Raw
● Te tātari polyedenlatelsion (APA)
● Te tātaritanga whakawhiti whakawhiti
● Te tātari whaikorero rereke
● Te tirotirohanga a te Universal Universal (Busco) Tātaritanga
● Te tātaritanga whakawhiti tuhinga: te matapae o nga waahanga coding (CD) me te whiwhinga mahi
● LNCRNA Tātaritanga: Tuhinga o mua LNCRNA me nga whaainga
● Te tautuhi a te Misioni (SSR)
Tātaritanga Busco
Te tātaritanga tuku iho
Te tātari polyedenlatel (APA)
Tuhinga o mua
Torotoro i nga Whakamua i nga ratonga a Bmkgene '
Ma, Y. et al. (2023) 'Te tātaritanga whakatairite o te pacbio me nga tikanga taapiri mo te nemopilea notoru', gemunics, 115 (6), p. 110709. DIE: 10.1016 / J.YGeno.2023.110709.
Chao, Q. et al. (2019) 'Ko nga hihiri whanaketanga o te Populus Stem Transcript', whakato tipu Biotechnologl, 17 (1), wh. 206-219. doi: 10.1111 / PBI.12958.
DENT, H. ET al. (2022) 'Huringa hihiri i roto i te ihirangi o te waikawa ascorbic i te whanaketanga hua me te tipu o te Acorinidia Latifolo 5808. DEI: 10.3390 / IJMS23105808 / S1.
Hua, x. et al. (2022) 'Te matapae tika o nga ira koiora i roto i nga polyphyllylins Bioctive doi: 10.1038 / S42003-022-03000-Z.
Liu, M. et al. (2023) 'Whakakotahihia te Pacbio ISO-SEA me te tātari a Illumina RNA-SE-SEA o te Tuta Affoluta (Merick) Transcript me te Cytochrome P450 Genes, 14 (4), P. 363. Doi: 10.3390 / pepeke140363 / S1.
Wang, Lijun et al. (2019) 'He rangahau mo te matatini tuhi ma te whakamahi i te tātaritanga tuuturu-molemu-molemuni-a-Illumina mo te tino pai ki a Ricinoletic BiossShetis', BMC, PP. 1 (1). doi: 10.1186 / S12864-019-5832-9.
