De novo based genese geneany
Ka whakaratohia e matou he ratonga huakita huakita oti, te taurangi i te 0 Gaps. Ka taea tenei ma te whakauru i nga hangarau taimana roa, penei i te Nanoperore me Pacbio mo te huihuinga me te panui poto me te Illumina me te whakatikatika i te panui o te Rānuitanga. Ko ta maatau ratonga e whakarato ana i nga mahi bionformac oti mai i te huihuinga, te tohu mahi, me te tātari i te bionfinsiformatic, te whakatutuki i nga whaainga rangahau. Ma tenei ratonga e taea ai te whakawhanaketanga o nga ira tohu totika mo nga rangahau ira me te genimic. Hei taapiri, ka hangaia e ia te putake mo nga tono penei i te arorau o te hangarau, me te whakarite i te pono me te miihini-kore-a-ira me te miihini hou.
Āhuatanga Ratonga
● me nga whiringa ka taea e rua hei whiriwhiri mai i te tohu o te tohu o te genome.
● Ko te tohu Gentome Kōnae: He poto te panui me te Illumina Novaseq Pe150.
● Whakaotia 0 geome gone.
● Te panui-roa-roa i runga i te Prometion NanoPore 48 ko Pacbio Rebio mo te huihuinga giaony.
● Te panui poto-poto i Illumina Novaseq mo te whakakitenga me te whakatikatika hapa (nanopiko) ranei hei whakaputa i tetahi gionome.
Painga ratonga
●Ko te Gero-Gap Genome i whakamanahia: Ko te mea na te whakaurutanga o te Illumina Subquencing me te roa o te waa roa (nanopore, pacbio) ranei.
●Whakaotia nga mahi a Bionfinformacs:Kei roto i tenei ko te huihuinga ira tangata me te matapae mo nga waahanga whakahiato, te whakaputa i te ira tangata, me nga tirohanga rongonui penei i te whakaaro porohita.
●Tohungatanga pūkenga nui: Neke atu i te 20,000 nga momo whaikorero i huihuia, ka puta te roopu o te BMKGENE, he ropu tohunga mohio, whanui, tautoko tautoko pai.
●Tautoko Kaainga-Hokohoko:Ko ta tatou pumau ki te whakaoti i te otinga o te kaupapa me te waa 3-marama i muri i te waa. I roto i tenei waa, ka whakaekea e maatau te kaupapa whai ake, e pa ana ki te awhina, me te Q & he huihuinga hei whakatika i nga paatai e pa ana ki nga hua.
●He maha nga rautaki taapiri e waatea ana:Mo nga kaupapa rangahau me nga whakaritenga o te giaoni oti.
Whakariterite Ratonga
| Whakatikatika | Rautaki rautaki |
| Tauira gentome | Illumina P150 100x |
| 0 gome genome | NANOPORE 100X + DEMEDIN P150 100X Or Pacbio HIFI 30x + DEMEDIN P150 100X (Kōwhiringa) |
Tauira Tauira:
| Te kukū (ng / μl) | Tapeke (μg) | Rōrahi (μl) | OD260 / 280 | OD260 / 230 | |
| Pacbio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| Nanonga | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| Illumina | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· Nga huakita: ≥3.5x1010 pūtau
Rere mahi ratonga
Tauira tauira
Hanganga Whare Pukapuka
Tuhinga o mua
Tātaritanga Raraunga
I muri i nga ratonga hoko
Kei roto i te tātaritanga e whai ake nei:
● Te whakahaere kounga raraunga
● Huihuinga Gniny
● Te Huringa Huihuinga Huihuinga: Te matapae o nga CD me nga waahanga nui
● Te tohu mahi me nga papaa raraunga whanui maha (Haere, Kegg, me etahi atu) me nga papaa whakamua (kāri, me te VFDB, me te aha)
● Whakaaturanga Sentome
Ka whakaratohia e matou te gionome i roto i te hōputu hōu tere me te kōnae ira tohu (gff).
Ira ira - haere
Ira ira - carbohydrates
Veenume Visualization - Plato Plot
Tirohia te Whakauru Whakauru i te Ratonga GMKGENE's Baserial SensIOM Genese i roto i te kohinga kohinga.
Dai, w. et al. (2023) 'Te kitenga o te bacteroides Uniformis F18-22 hei rongoa mo te rongoa mo te maimoatanga o te coltitis o te tangata hauora',Tuhinga o mua24 (19), p. 14669. DOI: 10.3390 / IJMS241914669 / S1.
Kang, Q. et al. (2021) 'Ko te punaha muhubis-kore e uru ana ki te kawe i te Blaoxa-1 me te Blandm-1 mai i te Wildlife i Haina: Te Whakanui i te Hauora Hauora',Whakaurua te Zoology16, 16 (6), PP. 798-809. doi: 10.1111 / 1749-4877.12510.
Wang, tt et al. (2017) 'Ko te raupapa o te sencophyte Bacillus Flexus klbmp 4941 e whakaatu ana i tana tipu whakatairanga whakatairanga tipu me te turanga ira mo te tote tote',Journal of Biotechnology, 260, wh. 38-41. doi: 10.1016 / j.jbiootec.2017.09.001.
Wang, x. et al. (2021) 'Ko te aukati-whakaeke maha-a-ringa o Klebsiella ka tohe i te rereketanga o nga ira antimicrobial',Tuhinga o mua, 12, p. 754931. DOI: 10.3389 / FCMB.2021.7544931 / BIBTEX.
