16s / 18s / ona amplicon subencing-ngs
Āhuatanga Ratonga
● Pūhara Hiko: Illumina Novaseq.
● Whakakotihia o nga rohe poto o te 16s 16s, 18s me ona, i waenga i etahi atu whaainga.
● Nga whiringa ngawari o te amplicon.
● He wheako o mua mo te kaupapa whakarei maha.
Painga ratonga
●Whakakorekore-Koreutu:Te tautuhi tere o te whakahiato microbial i nga tauira taiao.
●Taumira teitei: I roto i nga waahanga iti i roto i nga tauira taiao.
●E whai kiko ana: Ngaahi Akoranga Hapori Hapori.
●Tātaritanga whai kiko whānui: Ko te paanui qiime2 hou (te tirohanga nui ki te miihini miihini) me nga mahi tātari kanorau i runga i nga tikanga o te papamahi, tohu, OTU / ASV.
●Tohungatanga pūkenga nui: Ki te 150 mano nga kaupapa taapiri Ampicon e whakahaere ana i ia tau, ko BMKGENE e kawe ana i te tekau tau, he ropu tino mohio, me te tautoko tautoko pai.
Whakariterite Ratonga
| Whare pukapuka | Rautaki rautaki | Ko nga raraunga i taunakitia |
| Ampkicon | Illumina P250 | 50/100 / 300K Tags (Panui takirua) |
Whakaritenga Ratonga
| Te kukū (ng / μl) | Tapeke (ng) | Rōrahi (μl) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● Whenua / Sludge: 1-2G
● Ko te ihirangi whekau-kararehe: 0.5-2g
● Nga Inito o te Waiata-pepeke: 0.1-0.25G
● te mata tipu (parataiao maoa): 0.1-0.5G
● Te hupa i roto i te parakete whakaranu): 0.1-0.5g
● Nga Maakete (kararehe nui): 0.5-2g
● Nga Kaupae (kiore): 3-5Grains
● Te waihini alveolar alveolar dividage: pepa tātari
● Vagiinal Swab: 5-6 Swabs
● Swab kiri / Genital / salita / kiko ngohengohe / spab / spab / rewal swab: 2-3 swabs
● Nga Microorganism STARE: Pepa Tātari
● Te wai / Air / Biofilm: pepa tātari
● Endophyte: 1-2G
● Te tohu o te niho: 0.5-1g
Rere mahi ratonga
Tauira tauira
Hanganga Whare Pukapuka
Tuhinga o mua
Tātaritanga Raraunga
I muri i nga ratonga hoko
Kei roto i te tātaritanga e whai ake nei:
- Raraunga Kounga raraunga Raw
- OTU tautau / de-haruru (ASV)
- OTU Whakanui
- Te tātaritanga rereketanga alpha: Ko nga tohu maha, tae atu ki a Shannon, Simpson me Ace.
- Te tātari i te Diversity
- Tātaritanga-a-roopu
- Te tātaritanga whakatikatika: i waenga i nga ahuatanga taiao me te whakaputa me te rereketanga
- 16s matapae ira tangata
Tuhinga o mua
Ko te mapi wera o te taake
Te tātaritanga rereketanga alpha: pihi o te uaua
Te tātaritanga Diversity Beta: NMDS
Tātaritanga Intergroup: Lefse Biomarker
Tirohia te Whakauru i nga Whakauru i Whakatutuhia e nga Ratonga Haangai a AMPICENE AMPGENGENE me IDEDINEROS na roto i te kohinga kohinga.
Dong, C. ET al. (2022) Huihuinga, ko Microbiotaa, me te mahi o te Rhizosper oneone me te kiri Microbiota i roto i te Microbiology, 13. DICI: 10.3389 / Ki tonu.
Li, y. et al. (2023) 'Ko te whakawhitinga o te miihini o te Gardrella Vagainasis i roto i te Mice', Microbiome, 11 (1), PP. 1-14. doi: 10.1186 / S40168-023-01497-Y
Ko Yang, J., Fu, Y. me Liu, H. (2022) 'Microbioms of Air i kohia i te wa o te Whakataetae o te Ao. " 1-20. doi: 10.1186 / S40793-022-00399-0 / Tauira / 8.
Yin, s. et al. (2022) 'Whangato-whakawhirinaki nui o nga ira mahi e pa ana ki te hauota hauota e whakahaere ana i te hauota', hangarau hangarau koiora, 361, wh. 127678. Doi: 10.1016 / J.Biorch.2022.127678.
