● Mitaky genome reference.
● Nampiana ADN Lambda hanaraha-maso ny fahombiazan'ny fiovam-po amin'ny bisulfite.
● Fizarana amin'ny Illumina NovaSeq.
●Gold Standard ho an'ny fikarohana methylation ADN: Ity teknolojia fanodinana methylation matotra ity dia manana fahitsiana avo lenta ary azo averina tsara.
●Fandrakofana midadasika sy fanapahan-kevitra tokana fototra:Ny fahitana ny tranokala methylation amin'ny haavon'ny genome.
●Sehatra feno:manome serivisy tokana tokana manomboka amin'ny fanodinana santionany, fananganana tranomboky, filaharana mankany amin'ny fanadihadiana bioinformatika.
●Extensive Expertise: miaraka amin'ny tetikasa fandrindrana WGBS vita soa aman-tsara amin'ny karazana karazana isan-karazany, ny BMKGENE dia mitondra traikefa nandritra ny folo taona, ekipa mpanadihady tena mahay, votoaty feno ary fanohanana tsara taorian'ny varotra.
●Ny fahafahana miditra amin'ny Transcriptomic Analysis: mamela ny famakafakana mitambatra ny WGBS miaraka amin'ny angona omics hafa toy ny RNA-seq.
-BOKIN'NY Vavolombelon'i Jehovah | Strategy Sequencing | Famoahana angona soso-kevitra | Fanaraha-maso ny kalitao |
Bisulfite tsaboina | Illumina PE150 | 30x ny halaliny | Q30 ≥ 85% Bisulfite fiovam-po> 99% |
Fifantohana (ng/µL) | Vola manontolo (µg) | Fepetra fanampiny | |
ADN génomika | ≥ 5 | ≥ 400 ng | Fanimbana na fandotoana voafetra |
Ahitana izao fanadihadiana manaraka izao:
● Fanaraha-maso ny kalitaon'ny filaharana manta;
● Fametahana sarintany mba hanondroana génome;
● Fikarohana ny fototra methylated 5mC;
● Famakafakana ny fizarana methylation sy ny fanamarihana;
● Famakafakana ny faritra misy methylated differentially (DMRs);
● Famaritana momba ny fototarazo mifandray amin'ny DMR.
5mC methylation detection: karazana tranokala methylated
Sarintany methylation. 5mC methylation génomé distribution
Fanamarihana momba ny faritra be methylated
Faritra misy methylated: fototarazo mifandray
Faritra misy methylated: fanamarihan'ny fototarazo mifandraika (Gene Ontology)
Tadiavo ny fivoaran'ny fikarohana nataon'ny BMKGene manontolon'ny tolotra fandrindrana bisulfite genome amin'ny alàlan'ny fanangonana boky voarindra.
Fan, Y. et al. (2020) 'Famakafakana ny mombamomba ny methylation ADN mandritra ny fivoaran'ny hozatry ny taolan'ondry amin'ny alàlan'ny filaharan'ny bisulfite-genome manontolo',BMC Genomics, 21(1), p. 1–15. doi: 10.1186/S12864-020-6751-5.
Zhao, X. et al. (2022) 'Novoly deoxyribonucleic acid methylation perturbations amin'ny mpiasa voan'ny vinyl chloride',Toxicology and Industrial Health, 38(7), p. 377–388. doi: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. et al. (2020) 'Fifandraisana eo amin'ny methylation génomé, haavon'ny RNA tsy misy code, mRNA ary metabolites amin'ny voankazo voatabia masaka',The Plant Journal, 103(3), p. 980–994. doi: 10.1111/TPJ.14778.