Fizarana bisulfite mihena (RRBS)
Nipoitra ho safidy lafo vidy sy mahomby amin'ny Sequencing Bisulfite Genome (WGBS) amin'ny fikarohana methylation ADN. Na dia manome fomba fijery feno aza ny WGBS amin'ny fandinihana ny fototarazo manontolo amin'ny famahana fototra tokana, ny vidiny avo dia mety ho mametra. Ny RRBS dia manalefaka io fanamby io amin'ny alàlan'ny famakafakana ny ampahany solontenan'ny genome. Ity fomba fiasa ity dia miankina amin'ny fanatsarana ny faritra manankarena amin'ny nosy CpG amin'ny alàlan'ny fizarazarana MspI arahin'ny fifantenana habe amin'ny sombiny 200-500/600 bps. Noho izany, ny faritra akaiky amin'ny nosy CpG ihany no alahatra, fa ireo manana nosy CpG lavitra dia tsy tafiditra ao anatin'ny fanadihadiana. Ity dingana ity, miaraka amin'ny fizotry ny bisulfite, dia ahafahana mamantatra ny methylation ADN, ary ny fomba fiasa, PE150, dia mifantoka manokana amin'ny faran'ny insert fa tsy eo afovoany, mampitombo ny fahombiazan'ny methylation profiling. Ny RRBS dia fitaovana tena sarobidy izay ahafahan'ny fikarohana methylation ADN mahomby sy mampandroso ny fahalalana momba ny mekanika epigenetika.
Service Features
● Mitaky genome reference.
● Ny ADN Lambda dia ampiasaina hanaraha-maso ny fahombiazan'ny fiovan'ny bisulfite.
● Araha-maso ihany koa ny fahombiazan'ny fandevonan-kanina MspI.
● Fandevonana anzima indroa ho an'ny santionan'ny zavamaniry.
● Fizarana amin'ny Illumina NovaSeq.
Tombontsoa amin'ny serivisy
●Alternative mahomby sy mahomby amin'ny WGBS: ahafahana manao ny famakafakana amin'ny vidiny mora kokoa sy amin'ny fepetra takiana santionany ambany kokoa.
●Sehatra feno:manome serivisy tokana tokana manomboka amin'ny fanodinana santionany, fananganana trano famakiam-boky ary filaharana amin'ny fanadihadiana bioinformatika.
●Extensive Expertise: miaraka amin'ny tetikasa fandrindrana RRBS vita soa aman-tsara amin'ny karazana karazana isan-karazany, ny BMKGENE dia mitondra traikefa maherin'ny folo taona, ekipa mpanadihady tena mahay, votoaty feno ary fanohanana faran'izay tsara aorian'ny varotra.
Service Specifications
| -BOKIN'NY Vavolombelon'i Jehovah | Strategy Sequencing | Famoahana angona soso-kevitra | Fanaraha-maso ny kalitao |
| MspI levonina sy bisulfite tranomboky | Illumina PE150 | 8 Gb | Q30 ≥ 85% Bisulfite fiovam-po> 99% MspI fahombiazana fanapahana > 95% |
Fepetra takiana
| Fifantohana (ng/µL) | Vola manontolo (µg) |
| |
| ADN génomika | ≥ 30 | ≥ 1 | Fanimbana na fandotoana voafetra |
Fizotry ny asa fanompoana
Fanaterana santionany
Fananganana tranomboky
Sequencing
Famakafakana angona
Serivisy aorian'ny varotra
Ahitana izao fanadihadiana manaraka izao:
● Fanaraha-maso ny kalitaon'ny filaharana manta;
● Fametahana sarintany mba hanondroana génome;
● Fikarohana ny fototra methylated 5mC sy ny famantarana motif;
● Famakafakana ny fizarana methylation sy ny fampitahana santionany;
● Famakafakana ny faritra misy methylated differentially (DMRs);
● Famaritana momba ny fototarazo mifandray amin'ny DMR.
Fanaraha-maso ny kalitao: fahombiazan'ny fandevonan-kanina (amin'ny sarintany génome)
Fanaraha-maso ny kalitao: fiovam-po bisulfite (amin'ny fitrandrahana fampahalalana methylation)
Sarintanin'ny methylation: 5mC methylation génome-wide distribution
Fampitahana santionany: Famakafakana ny singa fototra
Fandinihana ny faritra samihafa methylated (DMRs): heatmap
Tadiavo ny fivoaran'ny fikarohana nataon'ny BMKGene manontolon'ny tolotra fandrindrana bisulfite genome amin'ny alàlan'ny fanangonana boky voarindra.
Li, Z. et al. (2022) 'Reprogramming avo lenta amin'ny sela Leydig amin'ny alàlan'ny fampahavitrihana CRISPR sy ny paracrine factor',PNAS Nexus, 1(4). doi: 10.1093/PNASNEXUS/PGAC179.
Tian, H. et al. (2023) 'Genome-wide DNA methylation analysis of body composition in Chinese monozygotic twins',Gazety Eoropeana momba ny fanadihadiana klinika, 53(11), p. e14055. doi: 10.1111/ECI.14055.
Wu, Y. et al. (2022) 'ADN methylation sy waist-to-hip ratio: epigenome-wide association study in Chinese monozygotic twins',Journal of Endocrinological Investigation, 45(12), p. 2365–2376. doi: 10.1007/S40618-022-01878-4.
