Prokaryotic RNA Sequencing
Toetoetra
● Ny fanodinana santionany RNA dia tafiditra ao amin'ny RRNE DAPLIETION ary narahin'ny fanomanana trano RNA RNA.
● Ny famakafakana bioinformatic mifototra amin'ny alignment amin'ny genome fanondroana
● Ny famakafakana dia misy ny fanehoan-kevitra sy ny vava ary ny firafitry ny fandikana sy ny famakafakana SRNA
Tombontsoa amin'ny serivisy
●Fifehezana tsara: Manatanteraka ireo teboka mifehy ny fifehezana fototra amin'ny dingana rehetra isika, avy amin'ny santionany sy ny fanamboarana trano hipetrahana sy ny bioinformatics. Ity fanaraha-maso ara-tsaina ity dia miantoka ny fandefasana ny valiny avo lenta tsy miova.
●Data momba ny fanoratana ny kofehy manokana: Noho ny fanomanana ny tranomboky RNA dia misy torolàlana, manome fahafantarana ny famantarana ny anti-sencal.
●Ny famakafakana tanteraka mifanaraka amin'ny transcriptom prokaryotika: Ny fantsom-bolo bioinformatic dia tsy ny famakafakana fotsiny ny fanehoana ny fototarazo fa ny famakafakana ny firafitry ny transcript, ao anatin'izany ny fampahafantarana ny operons, utrs sy promoter. Tafiditra ao ihany koa ny famakafakana ny snras, ny fanangonan-tena sy ny faminaniana momba ny firafitra sy ny kendrena faharoa.
●Fanohanana aorian'ny varotra: Ny fanoloran-tenantsika dia miitatra mihoatra ny fahavitan'ny tetikasa miaraka amin'ny vanim-potoana serivisy mandritra ny 3 volana aorian'ny famarotana. Mandritra izao fotoana izao, manolotra fanampiana momba ny fanarahana ny tetikasa izahay, fanampiana fanampiana, ary ny fivoriana Q & A Seeks mba hamahana ireo fanontaniana mifandraika amin'ny valiny.
Fangatahana santionany sy fanaterana
| -BOKIN'NY Vavolombelon'i Jehovah | Paikady Sequencing | Data natolotra | Ny fifehezana kalitao |
| Rrna dia nihena ny trano fitehirizam-bokatra | Illumina Pe150 | 1-2 GB | Q30≥85%% |
Fangatahana santionany:
| Conc. (Ng / μl) | Vola (μg) | fahadiovana | Tsy Nivadika |
| ≥ 50 | ≥ 1 | OD260 / 280 = 1,8-2.0 OD260 / 230 = 1.0-2.5 Voafetra na tsy misy proteinina na dna fisarahana aseho amin'ny gel. | Rin≥6.5 |
Fanaterana santionany
Fitaovana: 2 ml centrifuge Tube (Tin Foil tsy voalaza)
Famantarana modely: Vondrona vondrona + ohatra ohatra A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Fandefasana:
1. Ny ranomandry-maina: ny santionany dia mila fatana ao anaty kitapo ary alevina amin'ny ranomandry maina.
2. Fantsona rnabe: Ny santionany RNA dia mety ho maina ao amin'ny Tube RNA Stabilization (EG rnastable®) ary nalefa tamin'ny mari-pana.
Mikoriana ny asa fanompoana
Fanaterana sampana
Fanamboarana trano
Sequencing
Famakafakana data
Serivisy serivisy
Bioinformatic Analysis Workflow
Dia ahitana ny famakafakana manaraka:
● Ny fanaraha-maso ny angon-drakitra momba ny kalitao
● Fampitahana amin'ny Genome Remonion
● Ny fanombanana kalitao: RNA FRGMENTATION REBONDRANA, ampidiro ny haben'ny sy ny saturation saturation
● Fanangonam-bidy miasa amin'ny fototarazo voamarina
● Famakafakana fomba fitenenana: famakafakana sy famakafakana fototra (PCA)
● Fampisehoana mahazatra (DEGS)
● Fanaron-doha sy fanatsarana ny Degs
● Famakafakana SRNA: Faminaniana, fanangonan-tsaina, kendrena, ary faminaniana sivana faharoa
● Famakafakana ny firafitry ny transcript: Operom, manomboka sy mamarana toerana, faritra tsy voamarina (UTS), mpanentana, ary SNP / Inqual Analy
Saturation saturation
Fanangonam-bidy miasa amin'ny fototarazo
Ny fanitsiana eo anelanelan'ny santionany
Fandinihana ny fototarazo (degs) samy hafa
Famakafakana fanangonam-bokatra
Srna Annotation
Diniho ny fandrosoana fanamelohana an'i BMKGENE's Nanopore's Nanopore manontolo ny serivisy Sequencing ao amin'ny boky nasongadina.
Guan, CP et al. (2018)) 'Global Transcriptome Miangavy ny STAPHYLOCOCCCCHUCIDISMIRAMISMIDISA NY ALKALOIDS TOTAL ALKALO ALOPUCUROIDES',Gazety poloney an'ny mikrobiolojia, 67 (2), p. 223. Doi: 10.21307 / Pjm-2018-024.
