-
BMKMANU S3000_Spatial Transcriptome
Ny transcriptomic spatial dia mijoro ho lohalaharana amin'ny fanavaozana siantifika, manome hery ny mpikaroka handalina ny fomba fanehoana fototarazo be pitsiny ao anatin'ny tavy sady mitahiry ny tontolon'ny habakabaka. Ao anatin'ireo sehatra isan-karazany, ny BMKGene dia namolavola ny Chip Transcriptome Spatial BMKManu S3000, izay mirehareha amin'ny famaha 3.5µm nohatsaraina, mahatratra ny salan'isa subcellular, ary mamela ny famahana vahaolana amin'ny ambaratonga maro. Ny puce S3000, izay ahitana toerana 4 tapitrisa eo ho eo, dia mampiasa microwells misy vakana feno baoritra fisamborana spatial. Ny tranomboky cDNA, nohamafisina amin'ny kaody spatial, dia nomanina avy amin'ny chip S3000 ary avy eo apetraka amin'ny sehatra Illumina NovaSeq. Ny fitambaran'ny santionany misy barcode spatial sy UMI dia miantoka ny fahamarinan'ny angon-drakitra vokarina. Ny chip BMKManu S3000 dia tena maro be, manolotra famahana famahana ambaratonga marobe izay azo ampifanarahana tsara amin'ny tavy samihafa sy ny haavon'ny antsipiriany. Ity fampifanarahana ity dia mametraka ny chip ho safidy miavaka ho an'ny fandalinana transcriptomic spatial isan-karazany, miantoka ny clustering spatial mazava tsara miaraka amin'ny tabataba kely. Ny fampiasana teknolojia fizarana sela miaraka amin'ny BMKManu S3000 dia mamela ny famerana ny angon-drakitra transcription amin'ny sisin'ny sela, ka miteraka famakafakana misy dikany biolojika mivantana. Fanampin'izay, ny famahana ny S3000 nohatsaraina dia miteraka fototarazo sy UMI maro kokoa hita isaky ny sela, ahafahan'ny famakafakana marina kokoa ny lamin'ny transcription spatial sy ny fanangonana sela.
-
RNA Sequencing nokleary tokana
Ny fampivoarana ny fisamborana sela tokana sy ny teknikan'ny fananganana tranomboky manokana, miaraka amin'ny filaharana avo lenta, dia nanova ny fandalinana fanehoana ny fototarazo amin'ny ambaratonga sela. Ity fandrosoana ity dia mamela ny famakafakana lalindalina kokoa sy feno kokoa momba ny isan'ny sela saro-takarina, mandresy ny fetra mifandray amin'ny salan'isa fanehoana ny fototarazo eo amin'ny sela rehetra ary mitahiry ny tena heterogène ao anatin'ireo mponina ireo. Raha manana tombony tsy azo lavina ny sequence RNA sela tokana (scRNA-seq), dia miatrika fanamby amin'ny tavy sasany izay sarotra ny famoronana fampiatoana sela tokana ary mitaky santionany vaovao. Ao amin'ny BMKGene, miatrika ity sakana ity izahay amin'ny alàlan'ny fanolorana ny sequencing RNA nucleus tokana (snRNA-seq) amin'ny fampiasana ny teknolojia 10X Genomics Chromium manara-penitra. Ity fomba fiasa ity dia manitatra ny santionan'ny santionany mifanaraka amin'ny famakafakana transcriptome amin'ny ambaratonga sela tokana.
Ny fitokanana ny nokleary dia vita amin'ny alàlan'ny chip 10X Genomics Chromium vaovao, misy rafitra microfluidics valo misy fantsona misy fiampitana roa. Ao anatin'ity rafitra ity, ny vakana gel izay misy barcodes, primers, enzymes, ary nucleus tokana dia voahodidin'ny menaka mitete nanoliter, mamorona Gel Bead-in-Emulsion (GEM). Aorian'ny fananganana GEM, ny lysis sela sy ny famoahana barcode dia mitranga ao anatin'ny GEM tsirairay. Aorian'izay, ny molekiola mRNA dia mandalo transcription mivadika ho cDNA, mampiditra barcode 10X sy Unique Molecular Identifiers (UMIs). Ireo cDNA ireo dia iharan'ny fananganana tranomboky manara-penitra, manamora ny fikarohana matanjaka sy feno momba ny mombamomba ny fanehoana fototarazo amin'ny ambaratonga tokana.
Platform: 10× Genomics Chromium sy Illumina NovaSeq Platform
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Ny transcriptomic spatial dia teknôlôjia manara-penitra izay ahafahan'ny mpikaroka manadihady ny fomba fanehoana fototarazo ao anatin'ny tavy sady mitahiry ny tontolon'ny habakabaka. Sehatra matanjaka iray amin'ity sehatra ity ny 10x Genomics Visium miaraka amin'ny filaharana Illumina. Ny fitsipiky ny 10X Visium dia mipetraka amin'ny puce manokana misy faritra fisamborana voatondro izay ametrahana fizarana tavy. Ity faritry ny fisamborana ity dia misy toerana misy barcode, izay mifanitsy amin'ny toerana misy azy manokana ao anatin'ny tavy. Ireo molekiola RNA voasambotra avy amin'ny tavy dia asiana marika amin'ny famantarana molekiola tokana (UMI) mandritra ny dingan'ny fandikana mivadika. Ireo toerana misy barcode sy UMI ireo dia manome alalana ny fametahana spatial mazava tsara sy ny fanombanana ny fanehoana fototarazo amin'ny famahana sela tokana. Ny fitambaran'ny santionany misy barcode spatial sy UMI dia miantoka ny fahamarinan'ny angon-drakitra vokarina. Amin'ny alàlan'ny fampiasana an'io teknolojia Spatial Transcriptomics io, ny mpikaroka dia afaka mahazo fahatakarana lalindalina kokoa ny fandaminana spatial ny sela sy ny fifaneraserana molekiola sarotra mitranga ao anatin'ny tavy, izay manome fomba fijery sarobidy momba ny mekanika mifototra amin'ny fizotry ny biolojika amin'ny sehatra maro, anisan'izany ny oncology, ny neuroscience, ny biolojia fampandrosoana, ny immunology. , ary fandalinana botanika.
Platform: 10X Genomics Visium sy Illumina NovaSeq
