mRNA-seq (NGS) miaraka amin'ny genome reference

Ny RNA-seq dia fitaovana manara-penitra manerana ny siansa momba ny fiainana sy ny fambolena, mamehy ny elanelana misy eo amin'ny fototarazo sy ny proteome. Ny tanjany dia ny fitadiavana transcripts vaovao sy ny fanombanana ny fiteniny amin'ny assay iray. Ampiasaina betsaka amin'ny fandalinana transcriptomic fampitahana izy io, manazava ny fototarazo mifandraika amin'ny toetra na phenotypes isan-karazany, toy ny fampitahana ny mutants amin'ny karazana bibidia na ny fanehoana ny fitenenan'ny fototarazo ao anatin'ny fepetra manokana. Ny BMKCloud mRNA (Reference) APP dia mampiditra ny fatran'ny fanehoan-kevitra, ny famakafakana ny fanehoan-kevitra samihafa (DEG), ary ny famakafakana ny firafitry ny filaharana ao amin'ny fantsona bioinformatics mRNA-seq (NGS) ary mampitambatra ny tanjaky ny rindrambaiko mitovy, miantoka ny fahafaham-po sy ny fahatsaran'ny mpampiasa. Ny mpampiasa dia afaka mampakatra ny angon-dry zareo RNA-seq any amin'ny rahona, izay atolotry ny App ny vahaolana famakafakana bioinformatic feno sy tokana. Fanampin'izany, manao laharam-pahamehana ny traikefan'ny mpanjifa, manolotra asa manokana mifanaraka amin'ny filan'ny mpampiasa manokana. Ny mpampiasa dia afaka mametraka masontsivana ary manolotra ny iraka fantsona amin'ny tenany manokana, manamarina ny tatitra ifanakalozan-kevitra, mijery angon-drakitra / kisary ary mameno ny angon-drakitra fitrandrahana, toy ny: fifantenana fototarazo kendrena, clustering miasa, kisary, sns.