mRNA-seq (NGS) – De novo

Ny filaharana mRNA dia ahafahan'ny mombamomba ny transcript mRNA rehetra ao anaty sela ao anatin'ny fepetra manokana ary teknolojia ampiasaina betsaka amin'ny faritra fikarohana isan-karazany. Ny fantsona BMKCloud De novo mRNA-seq dia natao hamakafaka ny tranomboky filaharana poly-A raha tsy misy fototarazo reference. Ny fantsona dia manomboka amin'ny fanaraha-maso ny kalitao, arahin'nyde novotranscript assembly sy unigene set selection. Ny famakafakana rafitra unigene dia maminavina ny filaharan'ny coding (CDS) sy ny famerenana ny filaharana tsotra (SSR). Aorian'izay, ny famakafakana fanehoan-kevitra dia mahita fototarazo (DEGs) amin'ny toe-javatra voasedra, arahin'ny fanamarihan'ny asa sy ny fampitomboana ny DEG mba hanesorana ny fahitana biolojika.