Exclusive Agency for Korea

条形banner-03

Products

Fivoriambe Genome miorina amin'ny Hi-C

图片40

Hi-C dia fomba iray natao hisamborana ny chromosome amin'ny alàlan'ny fampifangaroana ny fifandraisana mifototra amin'ny akaiky sy ny filaharana avo lenta. Ny hamafin'ireo fifandraisana ireo dia heverina fa misy ifandraisany amin'ny elanelana ara-batana amin'ny chromosome. Noho izany, ny angon-drakitra Hi-C dia ampiasaina hitarihana ny fivondronana, ny filaharana ary ny fandrindrana ny filaharana miangona ao amin'ny fototarazo iray ary ny fametrahana ireo amin'ny krômôzôma maromaro. Ity teknôlôjia ity dia manome hery ny fivorian'ny génomôma ambaratongan'ny krômôzôma raha tsy misy sarintany fototarazo mifototra amin'ny mponina. Ny génome tsirairay dia mila Hi-C.


Details momba ny serivisy

Bioinformatics

Valin'ny Demo

Publications nasongadina

Service Features

● Fizarana amin'ny Illumina NovaSeq miaraka amin'ny PE150.

● Ny serivisy dia mitaky santionany amin'ny tavy, fa tsy asidra nokleika nalaina, mba hifandray amin'ny formaldehyde ary hitahiry ny fifandraisan'ny ADN-proteinina.

● Ny andrana Hi-C dia misy famerana sy fanamboarana farany amin'ny tendrony mipetaka amin'ny biotine, arahin'ny fanodikodinan'ny tendrony mibontsina vokatry ny fitehirizana ny fifandraisana. Esorina miaraka amin'ny vakana streptavidin ny ADN avy eo ary diovina ho fanomanana tranomboky manaraka.

Tombontsoa amin'ny serivisy

1Principle-ny-Hi-C-sequence

Vidin'ny Hi-C
(Lieberman-Aiden E et al.,Science, 2009)

Fanafoanana ny filàna angon-drakitra momba ny mponina:Ny Hi-C dia manolo ny fampahalalana ilaina ilaina amin'ny fananganana contig.

Haben'ny marika avo:mitarika ho amin'ny tahan'ny contig anchoring ambony mihoatra ny 90%.

Extensive Expertise and publication records:BMKGene dia manana traikefa be dia be amin'ny tranga 2000 mahery momba ny Hi-C Genome Assembly avy amin'ny karazana 1000 samihafa sy patanty isan-karazany. Mihoatra ny 200 ny tranga navoaka dia misy fiantraikany mitambatra mihoatra ny 2000.

Ekipa bioinformatika tena mahay:miaraka amin'ny patanty ao an-trano sy ny zon'ny mpamorona rindrambaiko ho an'ny fanandramana Hi-C sy ny famakafakana angon-drakitra, ny lozisialin'ny angon-drakitra momba ny maso novolavolain'ny tena dia ahafahan'ny fikandrana manodina, mamadika, manafoana ary mamerina.

Fanohanana aorian'ny varotra:Ny fanoloran-tenantsika dia mihoatra ny fahavitan'ny tetikasa miaraka amin'ny fe-potoana serivisy 3 volana aorian'ny fivarotana. Mandritra izany fotoana izany dia manolotra fanaraha-maso ny tetikasa, fanampiana famahana olana ary fotoam-pivoriana Q&A izahay mba hamahana ireo fanontaniana mifandraika amin'ny valiny.

Fanazavana feno: Mampiasa angon-drakitra maro izahay mba hanoratana ny fototarazo miaraka amin'ny fiovaovan'ny toetr'andro ary hanaovana ny fanadihadiana momba ny fanatsarana mifanaraka amin'izany, manome fanazavana momba ny tetikasa fikarohana maro.

Service Specifications

Fanomanana tranomboky

Strategy sequencing

Famoahana angona soso-kevitra

Fanaraha-maso ny kalitao

Tranomboky Hi-C

Illumina NovaSeq PE150

100x

Q30 ≥ 85%

Fepetra takiana

sela

Vola ilaina

Animal Viscera

≥ 2 g

Animal Muscle

Ra Mammalia

≥ 2 mL

Rà akoho amam-borona/trondro

Zavamaniry- Ravina vaovao

≥ 3 g

Sela kolontsaina

≥ 1x107

bibikely

≥ 2 g

Fizotry ny asa fanompoana

Sample QC

Famolavolana andrana

fanaterana santionany

Fanaterana santionany

Fanomanana tranomboky

Fananganana tranomboky

Sequencing

Sequencing

Famakafakana angona

Famakafakana angona

Serivisy aorian'ny varotra

Serivisy aorian'ny varotra


  • teo aloha:
  • Manaraka:

  • 流程图 羽莹-01

    1) Takelaka data QC

    2) QC tranomboky Hi-C: fanombanana ny fifandraisan'ny Hi-C manan-kery

    3) Fivoriambe Hi-C: fivondronan'ny contigs amin'ny vondrona, arahin'ny fibaikoana contig ao anatin'ny vondrona tsirairay ary manendry orientation contig

    4) fanombanana Hi-C

    Hi-C Library QC - fanombanana ny mpivady fifandraisana manan-kery Hi-C

     

    图片41

     

    Hi-C Assembly - antontan'isa

     

    图片42

    Fanombanana aorian'ny fivoriambe - sarintany mafana momba ny hamafin'ny famantarana eo anelanelan'ny daba

     

    图片43

    Tadiavo ny fandrosoana notarihin'ny serivisy fivoriambe Hi-C an'ny BMKGene amin'ny alàlan'ny fanangonana boky voarindra.

    Tian, ​​T. et al. (2023) 'Fangonan'ny génétique sy ny fanaparitahana fototarazo amin'ny germplasma katsaka mahatohitra hain-tany', Nature Genetics 2023 55:3, 55(3), p. 496–506. doi: 10.1038/s41588-023-01297-y.

    Wang, ZL et al. (2020) 'Fivoriamben'ny Chromosome-Scale of the Asian Honeybee Apis cerana Genome', Frontiers in Genetics, 11, p. 524140. doi: 10.3389/FGENE.2020.00279/BIBTEX.

    Zhang, F. et al. (2023) 'Fampisehoana ny fivoaran'ny biosynthesis alkaloid tropane amin'ny alalan'ny famakafakana génome roa ao amin'ny fianakaviana Solanaceae', Nature Communications 2023 14:1, 14(1), p. 1–18. doi: 10.1038/s41467-023-37133-4.

    Zhang, X. et al. (2020) 'Genomes of the Banyan Tree and Pollinator Wasp dia manome fanazavana momba ny Coevolution aviavy', Cell, 183(4), p. 875-889.e17. doi: 10.1016/J.CELL.2020.09.043

    mahazo teny iray

    Soraty eto ny hafatrao ary alefaso aminay

    Alefaso aminay ny hafatrao: