Hi-c fifamatorana chromatin mifototra
Serivisy serivisy
● Sequencing ao amin'ny ilumina Novaseq miaraka amin'ny Pe150.
● Ny serivisy dia mitaky santionany amin'ny tavy, fa tsy asslep nokleary, mifampitohy miaraka amin'i Formaldehyde ary miaro ny fifandraisan'ny ADN-Proteinina.
● Ny fanandramana hi-C dia misy famerana sy famaranana ny famaranana ny fefy mifatotra amin'ny biotin, ary arakaraka ny boribory ny fiafaran'ny fiafarana vokatry ny fiatrehana ny fifampiraharahana. Avy eo ny ADN dia voasarika miaraka amin'ny vakana strepletavidin ary nodiovina ho amin'ny fanomanana trano.
Tombontsoa amin'ny serivisy
●Ny fameperana ny enzim-bidy tsara indrindra: hiantohana ny fahombiazan'ny hi-C avo amin'ny karazany samihafa miaraka amin'ny tsiroaroa 93%.
●Fanamafisana sy firaketana an-tsoratra momba ny publication:BMKGENE dia manana traikefa be dia be miaraka amin'ny Tetikasa misy> 2000 hi-c Projects Hay avy amin'ny karazana 800 samihafa ary patanty isan-karazany. Taratasy pejy 100 mahery izay misy fiantraikany amin'ny fiatraikany mihoatra ny 900.
●Ekipa Bioinformatics tena mahay:Miaraka amin'ny patens ao an-trano sy ny zon'ny rindrambaiko ho an'ny fanandramana Hi-C sy ny famakafakana angon-drakitra sy ny rindrambaiko fampiasa an-tsary momba ny sary an-tsary.
●Fanohanana aorian'ny varotra:Ny fanoloran-tenantsika dia miitatra mihoatra ny fahavitan'ny tetikasa miaraka amin'ny vanim-potoana serivisy 3 volana aorian'ny famarotana. Mandritra izao fotoana izao, manolotra fanampiana momba ny fanarahana ny tetikasa izahay, fanampiana fanampiana, ary ny fivoriana Q & A Seeks mba hamahana ireo fanontaniana mifandraika amin'ny valiny.
●Anatiny feno: Mampiasa angon-drakitra marobe izahay mba hampangalaha ny fototarazo miaraka amin'ny voromahery fantatra ary manatanteraka ny famakafakana mifanaraka amin'ny fanatsarana, manome fomba fijery momba ny tetikasa fikarohana marobe.
Fanondroana ny serivisy
| -BOKIN'NY Vavolombelon'i Jehovah | Paikady Sequencing | Famokarana angon-drakitra | Fanapahan-kevitra momba ny hi-C |
| HI-C Tranomboky | Illumina Pe150 | Chromatin loop: 150x Tad: 50x | Chromatin loop: 10kb Tad: 40kb |
Fanampiana Fanompoana
| Sample Type | Vola takiana |
| Tavy biby | ≥2g |
| Ra manontolo | ≥2ml |
| holatra | ≥1g |
| Zavamaniry- young tissue | 1g / aliquot, 2-4 aliquotes no soso-kevitra |
| Sela kolontsaina | ≥1x107 |
Dia ahitana ny famakafakana manaraka:
● Data QC;
● Mapping sy Hi-C Latch Library QC: Ny tsiroaroa fifandraisana sy ny fifaneraserana mihidy (ides);
● Ny fifampiresahana mivaivay genome: ny famakafakana Cis / trans sy ny sarintany fiaraha-miasa hi-C;
● Analysis amin'ny fizarana efitrano A / B;
● Fampahafantarana ny tadiny sy ny tadivavarana chromatin;
● Fanadihadiana samihafa momba ny singa firafitry ny chromatin 3D eo amin'ny santionany sy ny fanangonam-barotra mifanaraka amin'ny fototarazo mifandray.
Ny fizarana CIS sy Trans fizarana
Heatmap of Chromosomal fifaneraserana eo amin'ny santionany
Fizarana genome-eraky ny fizarana A / B
Fizarana genome-eran'ny tadivavarana chromatin
Visualisation of tads
Diniho ny fandrosoana ara-pikarohana izay manamora ny serivisy Sequencing HI-C BMKGENE amin'ny alàlan'ny fanangonana boky vita an-tsoratra.
Meng, T. et al. (2021) 'Ny famakafakana fampitoviana iraisana mifandraika amin'ny CA2 ho toy ny kendrena novelika ho an'ny chordoma',Neuro-ontcology, 23 (10), p. 1709-1722. Doi: 10.1093 / Neuonc / Noba156.
Xu, L. et al. .ACTA PHARMACEUTICA SINICA B, 11 (10), p. 3150-3164. Doi: 10.1016 / J.APSB.2021.03.022.
