Genetic evolisiona
Tombontsoa amin'ny serivisy
Takagi et al.,Ny Gazety Fambolena, 2013
●Famakafakana bioinformatic feno:Ny fahazoana ny tombotsoan'ny fahasamihafana ara-pivavahana, izay taratry ny mety ho karazana evolisiona, ary mampiseho ny fifandraisan'ny phylogenetic azo itokisana eo amin'ny karazana misy fiantraikany lehibe amin'ny evolisiona miova sy ny evolisiona mifanalavitra
●Famakafakana namboarina manokana: toy ny tombantomban'ny fotoam-bidy sy ny hafainganam-pandeha mifototra amin'ny fiovan'ny nucleotide sy ny haavon'ny asidra amine.
●Faminaniana sy firaketana an-tsoratra: BMKGENE dia nanangona traikefa be dia be tamin'ny tetik'asa ara-pinoana sy ny evolisiona nandritra ny 15 taona, ary nanarona karazana an'arivony, ary nandray anjara tamin'ny tetikasa avo lenta avo lenta navoaka tamin'ny serasera natiora, ny zavamaniry molekiola, ny haino aman-jery biotechnology, sns.
● Ny ekipa bioinformatics be dia be sy ny tsingerin'ny famakafakana fohy: Tamin'ny traikefa lehibe tamin'ny famakafakana genomika mandroso, ny ekipan'i BMKGENE dia mamakafaka am-panadihadiana feno miaraka amin'ny fotoana fihodinana haingana.
● Fanohanana ny varotra:Ny fanoloran-tenantsika dia miitatra mihoatra ny fahavitan'ny tetikasa miaraka amin'ny vanim-potoana serivisy 3 volana aorian'ny famarotana. Mandritra izao fotoana izao, manolotra fanampiana momba ny fanarahana ny tetikasa izahay, fanampiana fanampiana, ary ny fivoriana Q & A Seeks mba hamahana ireo fanontaniana mifandraika amin'ny valiny.
Famaritana sy fepetra takiana
| Karazan-tsarimihetsika | Ny haben'ny mponina atolotry ny mponina | Paikady Sequencing | Fangatahana Nukleotide |
| Ny andian-dahatsoratra genome manontolo | ≥ Olona 30, miaraka amin'ny olona 10 avy amin'ny subgroup tsirairay
| 10x | Fifantohana: ≥ 1 ng / μl Fitambaran'ny 30ng Voafetra na tsy misy fanimbana na fandotoana |
| Sombin-toerana manokana (Slaf) manokana | Ny halaliny: 10x Isan'ny marika: <400 mb: Notondroina ny WGS <1GB: 100K Tags 1GB > 2GB: 300K Tags Tags 500k Tags | Fifantohana ≥ 5 ng / μl Fitambaran'ny ≥ 80 ng Nanodrop OD260 / 280 = 1.6-2.5 Agarose Gel: Tsia na fanimbana voafetra na fandotoana
|
Mikoriana ny asa fanompoana
Famolavolana fanandramana
Fanaterana sampana
Fanamboarana trano
Sequencing
Famakafakana data
Serivisy serivisy
Ny serivisy dia ahitana ny famakafakana ny firafitry ny mponina (ny hazo phylogenetic, ny tabilao Stratification), ny fahasamihafana ny mponina, ary ny fisafidianana ny mponina (ny fandrafetana ny fitrandrahana toerana misy ny toerana misy tombony. Ny serivisy dia mety misy ihany koa ny famakafakana namboarina (ohatra ny vanim-potoana tsy fahampian-tsakafo, ny fandehanan-dresaka).
*Ny valim-pifidianana naseho eto dia avy amin'ny Genomen izay nivoaka tamin'ny bmkgene
1.Volution Analysis dia misy ny fananganana hazo phylogenetic, firafitry ny mponina sy ny PCA mifototra amin'ny fiovan'ny fototarazo.
Ny hazo phylogenetic dia maneho ny fifandraisana ara-kandevika sy ny evolisiona eo amin'ireo karazana razambeny.
Ny PCA dia mikendry ny haka sary an-tsaina eo amin'ny sub-mponina.
Ny firafitry ny mponina dia mampiseho ny fisian'ny sub-sub-mponina miavaka amin'ny teny allele.
Chen, et. al.,Pnas, 2020
2.Ny hatsembohana
Ny hatsembohana voafantina dia manondro ny dingana iray izay voafidy sy ny fatran'ny toerana tsy miandany mifandray ary mihena ny tranokala tsy voaroy, ka mihena ny fampihenana ny faritra.
Ny fametahana genome-sakany amin'ny faritra voafantina voafantina dia ny fanodikojakojako ny fanondroana ny fototarazo (π, fst, tajima d) amin'ny snps rehetra ao anaty varavarankely sliding (100 kb) amin'ny dingana sasany (10 kb).
Fahasamihafana miafina (π)
Tajima d
Fanamboarana fanoratana (FST)
Wu, et. al.,Molecular zavamaniry, 2018
3.gene mikoriana
Wu, et. al.,Molecular zavamaniry, 2018
4.Demographic tantara
Zhang, et. al.,Ekoizy voajanahary & Evolisiona, 2021
5.DIVerGENCENCE Fotoana
Zhang, et. al.,Ekoizy voajanahary & Evolisiona, 2021
Diniho ny fandrosoana anamorana ny serivisy evolisiona evolisiona BMKGENE amin'ny alàlan'ny fanangonana boky vita an-tsoratra:
Hasanyar, ak et al. .Gazety iraisam-pirenena momba ny siansa molekiola, 24 (7). Doi: 10.3390 / ijms24076238.
Chai, J. et al. .Zoolojia fikarohana, 2022, vol. 43, Lahateny 3, pejy: 469-480, 43 (3), p. 469-480. Doi: 10.24272 / J.Sissn.2095-8137.2022.101.
Han, M. Et Al. .Frontier amin'ny siansa fototra, 13, p. 882601. Doi: 10.3389 / FPLS.2022.882601 / Bibtex.
Wang, J. et Al. (2022) 'Ny fahitana genomika ao amin'ny fivoaran'ny Longan avy amin'ny fivoriam-bokatra sy ny genomika an'ny mponina ary ny genomika an'ny mponina',Herticulture Research, 9. Doi: 10.1093 / HR / UHAC021.
