●Sehatra:MGI-DNBSEQ-T7
●Fomba filaharana:PE150
●Famindrana ny tranomboky Illumina mankanyMGI:mamela ny filaharan'ny angon-drakitra avo lenta amin'ny vidiny mora.
●Fanaraha-maso ny kalitaon'ny tranomboky alohan'ny filaharany.
●Fandefasana data QC sy fanaterana:fandefasana ny tatitra QC sy ny angona manta amin'ny endrika fastq taorian'ny demultiplexing sy ny sivana Q30 mamaky.
●Fahasamihafana amin'ny serivisy sequencing:ny mpanjifa dia afaka misafidy ny hanao sequence amin'ny lalana na ny habetsaky ny angona.
●Famoahana data avo lenta:1500 Gb/lalana
●Fanaterana ny tatitra QC manaraka:miaraka amin'ny metrika kalitao, ny fahamarinan'ny angona ary ny fampandehanana amin'ny ankapobeny ny tetik'asa filaharana.
●Dingan'ny filaharana matotra:miaraka amin'ny fotoana fohy fihodinana.
●Fanaraha-maso kalitao henjana: mampihatra fepetra hentitra QC izahay mba hiantohana ny fandefasana vokatra avo lenta tsy tapaka.
Haben'ny angona (X) | Fifantohana (qPCR/nM) | BOKY FAHA- | |
Lalana ampahany
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1nM | ≥ 25 μl |
10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
Làlana tokan-jotra | Per Lane | ≥ 1,5 nM / dobo fitehirizam-boky | ≥ 25 μl / dobo fitehirizam-boky |
Ho fanampin'ny fifantohana sy ny totalin'ny vola, dia ilaina ihany koa ny lamina tampony mety.
Fanamarihana: Ny filaharan'ireo tranomboky misy fahasamihafana ambany dia mitaky PhiX spike-in mba hiantohana ny fiantsoana fototra matanjaka.
Manoro hevitra izahay ny handefa tranomboky efa natambatra ho santionany. Raha toa ka mila BMKGENE ianao hanatanteraka fanangonana tranomboky, azafady jereo ny
takian'ny tranomboky amin'ny filaharan'ny lalana ampahany.
Ny tampony lehibe dia tokony ho ao anatin'ny 300-450 bp.
Ny trano famakiam-boky dia tokony hanana tampon-doha tokana, tsy misy fandotoana adaptatera ary tsy misy dimer primer.
Ny tatitra momba ny kalitaon'ny tranomboky dia omena alohan'ny filaharana, ny fanombanana ny habetsaky ny tranomboky ary ny fizarazarana.
Tabilao 1. Statistika momba ny angona manaraka.
ID santionany | BMKID | Raw mamaky | Data manta (bp) | Mamaky madio (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Sary 1. Fizarana kalitao miaraka amin'ny famakiana isaky ny santionany
Sary 2. Fizarana votoaty fototra
Sary 3. Fizarana ny votoaty vakiana amin'ny angon-drakitra filaharana