Loky Tranombokoloana vita mialoha
Toetoetra
●Platform:Illumina novEseq 6000 sy novaseq x plus
●Modely fanoratana:P150 sy Po250
●Ny fanaraha-maso ny kalitao amin'ny tranomboky alohan'ny hanoratana
●Ny angon-drakitra QC sy ny fandefasana:Ny fandefasana ny QC Report sy ny angon-drakitra amin'ny endrika FASTQ Aorian'ny FastQ aorian'ny fametahana ny demultips sy ny sivana Q30 dia mamaky
Tombontsoa amin'ny serivisy
●Versatility serivisy serivisy Sequencing:Ny mpanjifa dia mety hisafidy ny hirotsaka amin'ny alàlan'ny làlana, sela mikoriana, na amin'ny habetsaky ny angon-drakitra ilaina (fizarana lalan-tokana).
●Fanandramana be dia be momba ny sehatra Sequencing Spumina:amin'ireo tetikasa mihidy mihidy an'arivony misy karazany maro samihafa.
●Fanaterana ny tatitra QC Report:miaraka amin'ny metrika kalitao, ny angon-drakitra sy ny fampisehoana ankapobeny amin'ny tetikasa Sequencing.
●Ny dingana fanoratana matotra:miaraka amin'ny fihodinana fohy.
●Fifehezana tsara: Manatanteraka fepetra QC hentitra izahay mba hiantohana ny fandefasana ny valiny avo lenta tsy miova.
Sampana santionany
| Lampihazo | Mikoriana sela | Mode mode | Unit | Tombanana ny famoahana |
| Novaseq x | 10b (Lalan-dàlana 8) | P150 | Làlana tokan-jotra Fizarana ampahany | 375GB / Lane |
| 25B (Làlana 8) | P150 | Làlana tokan-jotra Fizarana ampahany | 1000 GB / Lane | |
| Novaseq 6000 | SP Flow Sell (Lalana 2) | PO250 | Mikoriana sela Làlana tokan-jotra Fizarana ampahany | 325-400 m mamaky / lalana |
| Sela Slow Flow (Lanes 4) | P150 | Mikoriana sela Làlana tokan-jotra Fizarana ampahany | ~ 800 GB / Lane |
Fangatahana santionany
| Data (X) | Fifantohana (QPCR / NM) | BOKY FAHA- | |
| Fizarana Lane Lane Sequencing
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
| 10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
| 50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
| X> 100 gb | ≥ 4 NM | ≥ 25 μl | |
| Lane Sequencing | Isaky ny lalana | ≥ 1.5 NM / Library Library | Dobo 25 μl / dobo filam-boky |
Ho fanampin'ny fifantohana sy ny habetsaky ny habetsaky ny habetsaky ny haingam-pandeha mety ihany koa.
Fanamarihana: Lane Sequencing amin'ny tranomboky ambany lobrater dia mitaky an'i Phix Spike-in mba hiantohana ny fiantsoana an'i Briust.
Manoro hevitra izahay handefa ireo tranomboky mialoha ny popoled ho santionany. Raha mila bmkgene ianao hanatanteraka ny dobo fitahirizam-boky, azafady mba jereo
ny fepetra takian'ny tranomboky amin'ny fizarana làlana amin'ny lalana.
Haben'ny tranomboky (sarintany peak)
Ny tampon-tampony dia tokony ho ao anatin'ny 300-450 BP.
Ny tranomboky dia tokony hanana fefy iray tokana, tsy misy fandotoana adapter ary tsy misy dimer primer.
Azafady mba alao aminay raha tsy mahafeno ny fepetra takian'ny fitaovana ny santionanao.
Service Workflow
Fifehezana ny kalitao
Sequencing
Ny fifehezana ny data
Fanaterana tetikasa
Tatitra QC Library
Ny tatitra momba ny kalitaon'ny tranomboky dia omena alohan'ny hanoroana ny fanoratana, fanombanana ny haben'ny tranomboky, ary ny fragmentation.
Fampandrenesana QC
Latabatra 1. Statistika momba ny angon-drakitra Sequencing.
| Id santionany | Bmkid | Mamaky ny raw | Data (BP) | Vakiana madio (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | Gc (%) |
| C_01 | Bmk_01 | 22.870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | Bmk_02 | 14,717.867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Sary 1. Ny fizarana kalitao miaraka amin'ny vakiana isaky ny santionany
Sary 2. Fizarana votoaty votoaty
Sary 3. Ny fizarana ny vinavina mamaky ny angon-drakitra
