Fivoriambe bakteria novo bakteria
Manome serivisy fivoriambe ara-barotra feno bakteria izahay, miantoka ny fiantohana 0 hantsana. Ity dia azo atao amin'ny fampidirana ireo teknolojia sequencing efa ela, toy ny nanopore sy ny pacbio ho an'ny fivoriambe sy ny fanoratana fohy fohy miaraka amin'i Illumina ho an'ny fanamarinana fivoriambe sy ny fanitsiana ny famerenam-bokatra. Ny serivisintsika dia manome ny asa bioinformatic feno avy amin'ny fivoriambe, ny fanangonam-bokatra, ary ny famakafakana bioinformatic mandroso, fanatanterahana tanjona fikarohana manokana. Ity serivisy ity dia ahafahan'ny fampandrosoana ny fitarainan'ny firesahana voafaritra ho an'ny fandalinana ara-barotra sy genomika isan-karazany. Ho fanampin'izany, io dia fototry ny fampiharana toy ny optimization, injeniera ara-barotra ary ny fampandrosoana ara-teknolojia, miantoka ny angon-drakitra Genomika tsy azo itokisana sy hantsana ho an'ny fandrosoana ny fahitana sy ny fanavaozana ara-tsiansa.
Serivisy serivisy
● Miaraka amin'ny safidy roa mety hisafidianana amin'ny miankina amin'ny ambaratonga faniriana fahafenoana génenteness.
● Draft Bill Genome: Sequencing fohy fohy miaraka amin'i Illumina Novaseq Pe150.
● feno 0 gasy genome.
● Sequencing lava be dia be ao amin'ny Nanopore Promethion 48 na Pacbio Revio ho an'ny fivorian'ny Genome.
● Sequencing fohy fohy ao amin'ny Illumina
Tombontsoa amin'ny serivisy
●Zero-Gap Genome Genome: Izany dia noho ny fampidirana an'i Illumina Sequencing miaraka amin'ny Sequencing Sequencing (nanopore na pacbio).
●Fenoy ny bioinformatics workflow:Anisan'izany ny fivoriambe sy ny faminaniam-bokatra générenika maro, ny fanangonam-bolo, ary ny vazaha Genome, ary ny Genome Genome toy ny tetika CIRCOS.
●Expertise be dia be: Miaraka amin'ny Genomia microjika 20000 mahery, dia mitondra traikefa am-polony ny BMKGENE, ekipa famakafakana iray mahay, votoaty feno, ary fanohanana ny varotra mialoha.
●Fanohanana aorian'ny varotra:Ny fanoloran-tenantsika dia miitatra mihoatra ny fahavitan'ny tetikasa miaraka amin'ny vanim-potoana serivisy 3 volana aorian'ny famarotana. Mandritra izao fotoana izao, manolotra fanampiana momba ny fanarahana ny tetikasa izahay, fanampiana fanampiana, ary ny fivoriana Q & A Seeks mba hamahana ireo fanontaniana mifandraika amin'ny valiny.
●Ny paikady manara-penitra marobe dia misy:Ho an'ireo tanjona fikarohana sy zavatra takiana amin'ny fahafenoana génenteness.
Fanondroana ny serivisy
| fanompoana | Paikady Sequencing |
| Draft Genome | Illumina Pe150 100x |
| 0 Genome Genome | Nanopore 100x + illumina pe150 100x Or Pacbio Hifi 30x + illumina Pe150 100x (tsy azo atao) |
Fangatahana santionany:
| Fifantohana (ng / μl) | Total be (μg) | Volume (μl) | OD260 / 280 | Od260 / 230 | |
| Pacbio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| Nanopore | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| Illumina | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· Bakteria: §3.5x1010 sela
Mikoriana ny asa fanompoana
Fanaterana sampana
Fanamboarana trano
Sequencing
Famakafakana data
Serivisy serivisy
Dia ahitana ny famakafakana manaraka:
● Ny fanaraha-maso ny data momba ny data
● Fivoriambe Genome
● Famakafakana singa genome: faminaniana ny CD sy singa genomika marobe
● Fanangonam-bokatra miasa amin'ny angon-drakitra ankapobeny (GO, Kegg, sns) ary angon-drakitra Advanced (Card, VFDB, sns)
● Visualisation Gene
Manome ny genome amin'ny endrika FASTA mora vidy sy ny rakitra Genome Annotation (GFF) isika.
Gene Annotation - Mandehana
Gene Annotation - Cazy Cazy Carbohundrates
Genome Visualization - PLOT CIRCOS
Diniho ny fandrosoana anamorana ny serivisy fivorian'ny Genome Genome Genome Bccterire amin'ny alàlan'ny fanangonana boky vita an-tsoratra.
Dai, W. et al. .Gazety iraisam-pirenena momba ny siansa molekiola, 24 (19), p. 14669. Doi: 10.3390 / ijms2419141414141419141914191414669 / S1.
Kang, Q. et al. .Zoology integrative, 16 (6), p. 798-809. Doi: 10.1111 / 1749-4877.12510.
Wang, TT et al. (2017) 'Genome feno amin'ny endophyte bacillus bacillus flexus klbmp 4941 dia manambara ny fomba fampiroboroboana ny zavamaniry sy ny fototarazo ho an'ny fandeferana sira',Gazety biolojika, 260, p. 38-41. Doi: 10.1016 / J.JBIOTEC.2017.09.001.
Wang, X. et al. .Frontier ao amin'ny Microbiology, 12, p. 754931. Doi: 10.3389 / fmicb.2021.754931 / Bibtex.
