Amplicon sequencing(16S/18S/ITS)

Ny filaharan'ny Amplicon (16S/18S/ITS) miaraka amin'ny Illumina dia fomba famakafakana ny fahasamihafan'ny mikraoba amin'ny alalan'ny famantarana ny mombamomba ny mikraoba araka ny filaharan'izy ireo ary avy eo manandrana mamadika ny harenan'ny vondrom-piarahamonina sy ny fahasamihafana ao anatin'ny santionany tsirairay sy eo anelanelan'ny santionany. Ny fantsona BMKCloud Amplicon (NGS) dia mamela ny famakafakana ny 16S, 18S, ITS ary ny fototarazo miasa maro. Manomboka amin'ny trimming vakiteny, fivorian'ny vakiteny mifanandrify ary fanombanana ny kalitao, arahin'ny fivondronan'ireo vakiteny mitovitovy amin'izany mba hamoronana Units Taxonomic Operational (OTU) ampiasaina amin'ny fizarana fanadihadiana enina samihafa. Ny fanamarihan'ny taxonomic dia manome fampahalalana momba ny habetsahana sy ny firafitry ny santionany tsirairay, raha ny famakafakana ny fahasamihafan'ny alpha sy beta kosa dia mifantoka amin'ny fahasamihafan'ny mikraoba ao anaty sy eo anelanelan'ny santionany. Ny famakafakana tsy mitovy eo amin'ny vondrona dia mahita ny OTU izay tsy mitovy amin'ny fampiasana fitsapana parametrika sy tsy parametrique, raha toa kosa ny fanadihadiana momba ny fifandraisana dia mampifandray ireo fahasamihafana ireo amin'ny anton-javatra ara-tontolo iainana. Farany, ny habetsahan'ny fototarazo miasa dia vinavinaina mifototra amin'ny habetsahan'ny fototarazo marika, manome fanazavana momba ny fiasa sy ny ekolojia amin'ny santionany tsirairay.