16s / 18s / ny amplicon
Serivisy serivisy
● Lampana mitory: Illumina novasteq.
● Fampihorohoro ny faritra fohy 16s, 18s sy ny azy, eo amin'ireo lasibatry ny amplification hafa.
● safidy tsara an'i AMPlicon.
● Ny traikefa momba ny tetikasa teo aloha misy lasibatra amplification marobe.
Tombontsoa amin'ny serivisy
●Mitokana-tsy misy:Fanondroana haingana ny famoronana microbial amin'ny santionany tontolo iainana.
●Fanapahan-kevitra avo lenta: Amin'ny singa ambany be dia be amin'ny santionany tontolo iainana.
●Azo ampiharina be: Fandalinana momba ny tontolo iainana microbial samihafa.
●Famakafakana bioinformatic feno: Ny fonosana Qiime2 farany farany (ny fahitana momba ny ekolojia Microbial) miaraka amin'ny famakafakana isan-karazany amin'ny resaka angona, annotation, otu / asv.
●Expertise be dia be: Tamin'ireo tetik'asa nasionaly 150 tapitrisa dolara izay natao isan-taona, ny BMKGENE dia mitondra traikefa am-polony, ekipa mpandinika mahay, dia manana votoaty feno, ary fanohanana ny varotra am-bava, ary ny fanohanana mialoha ny varotra.
Fanondroana ny serivisy
| -BOKIN'NY Vavolombelon'i Jehovah | Paikady Sequencing | Data natolotra |
| AMPLICON | Illumina pe250 | 50/100 / 300K Tags (vakio tsiroaroa) |
Fangatahana serivisy
| Fifantohana (ng / μl) | Total (ng) | Volume (μl) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● SOIL / SLUDGE: 1-2G
● Ny votoaty aody-biby: 0.5-2G
● Ny votoatin'ny tsinay-bibikely: 0.1-0.25g
● zavamaniry (sediment): 0.1-0.5G
● Ny felam-pihetseham-po mahery vaika dia naniratsira ny sediment): 0.1-0.5G
● Faeces (biby lehibe): 0.5-2G
● Feeces (totozy): 3-5grains
● Ny pulmonary alveolar Lavage Fluid: Sivana taratasy
● Swab Vaginal: 5-6 Swabs
● SWAB / swab / saliva / saliva / phary malefaka / pharyngeal swab / rectal swab: 2-3 swabs
● Ny microorganisming ambonin'ny tany: Sivana taratasy
● Ny rano / rivotra / biofilm: taratasy fanivanana
● Fiatoana: 1-2G
● takelaka nify: 0.5-1g
Mikoriana ny asa fanompoana
Fanaterana sampana
Fanamboarana trano
Sequencing
Famakafakana data
Serivisy serivisy
Dia ahitana ny famakafakana manaraka:
- Ny fanaraha-maso ny data momba ny kalitao
- Otu clustering / de-tabilao (ASV)
- Otu Annotation
- Famakafaka isan-karazany amin'ny alpha: Indexes marobe, anisan'izany i Shannon, Simpson ary Ace.
- Beta Diversity Analysis
- Famakafakana vondrona inter-vondrona
- Famakafakana fanitsiana: eo anelanelan'ny lafin-javatra tontolo iainana sy ny firafitra sy ny fahasamihafana
- 16s faminaniana fomban-drazana
Histogram an'ny fizarana taxonomika
Taxonomic be dia be ny sarintany hafanana
Famakafakana alfa isan-karazany: curve tsy fahita firy
Beta Diversity Analysisity: NMDS
Famakafakana intergroup: Fikarohana lefse biomominker
Diniho ny fandrosoana anamorana ny serivisy BMKGENE SEQUENCing Services miaraka amin'i Illumina amin'ny alàlan'ny fanangonana boky vita an-tsoratra.
Dong, C. et al. (2022) 'Fivoriambe, Microbiota, ary ny fiasa amin'ny rhizosphere sy ny bark mikraoba ao amin'ny EUCommia ulmoides', Frontier ao amin'ny Microbiology, 13 taona. Doi: 10.3389 / FMICB.2022.855317 / feno.
Li, Y. et al. (2023) Ny famindrana ny consplantia bakteria synthetic ho an'ny fitsaboana ny vaginosis bakterin-vaginosis ao amin'ny totozy ', microbiome, 11 (1), p. 1-14. Doi: 10.1186 / s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. and Liu, H. (2022) 'Microbiomes ny vovoka an'habakabaka nangonina nandritra ny fanandramana ara-pisakafoanana biordenerative miorina amin'ny tany " 1-20. Doi: 10.1186 / s40793-022-00399-0 / tarehimarika / 8.
Yin, S. et al. (2022) 'Feedstock-Miankina amin'ny fototarazo miasa mifandraika amin'ny fanovana azota voafehin'i Nitrogen 127678. Doi: 10.1016 / J.Biortech.2022.127678.
