
Maza RNS
Mazās RNS ir īsas nekodējošas RNS ar vidējo garumu 18-30 nt, ieskaitot miRNS, siRNS un piRNS, kurām ir svarīga loma regulēšanas procesos. BMKCloud sRNS cauruļvads nodrošina gan standarta, gan pielāgotu analīzi miRNS identificēšanai. Pēc nolasīšanas apgriešanas un kvalitātes kontroles nolasījumi tiek saskaņoti ar vairākām datu bāzēm, lai klasificētu sRNS un atlasītu miRNS un kartētu uz atsauces genomu. miRNS tiek identificētas, pamatojoties uz zināmām miRNS datu bāzēm, sniedzot informāciju par sekundāro struktūru, miRNS ģimeni un mērķa gēniem. Diferenciālās ekspresijas analīze identificē atšķirīgi izteiktas miRNS, un atbilstošie mērķa gēni ir funkcionāli anotēti, lai atrastu bagātinātas kategorijas.
Bioinformātikas darba plūsma
