-
BMKMANU S3000_Spatial Transcriptome
Telpiskā transkriptomika ir zinātnisko jauninājumu priekšgalā, dodot pētniekiem iespēju iedziļināties sarežģītos gēnu ekspresijas modeļos audos, vienlaikus saglabājot to telpisko kontekstu. Dažādās platformās uzņēmums BMKGene ir izstrādājis BMKManu S3000 telpisko transkripta mikroshēmu, kas lepojas ar uzlabotu izšķirtspēju 3,5 µm, sasniedz subcellulāro diapazonu un nodrošina vairāku līmeņu izšķirtspējas iestatījumus. S3000 mikroshēmā, kurā ir aptuveni 4 miljoni plankumu, ir izmantotas mikroiedobes, kas ir slāņotas ar lodītēm, kas ir ielādētas ar telpiski svītrkoda uztveršanas zondēm. cDNS bibliotēka, kas bagātināta ar telpiskajiem svītrkodiem, tiek sagatavota no S3000 mikroshēmas un pēc tam sekvencēta Illumina NovaSeq platformā. Telpiski svītrkodu paraugu un UMI kombinācija nodrošina ģenerēto datu precizitāti un specifiku. BMKManu S3000 mikroshēma ir ārkārtīgi daudzpusīga, piedāvājot daudzlīmeņu izšķirtspējas iestatījumus, kurus var precīzi pielāgot dažādiem audiem un vēlamajiem detalizācijas līmeņiem. Šī pielāgošanās spēja pozicionē mikroshēmu kā izcilu izvēli dažādiem telpiskās transkriptomikas pētījumiem, nodrošinot precīzu telpisku klasterizāciju ar minimālu troksni. Šūnu segmentācijas tehnoloģijas izmantošana ar BMKManu S3000 ļauj norobežot transkripcijas datus līdz šūnu robežām, kā rezultātā tiek iegūta analīze, kurai ir tieša bioloģiskā nozīme. Turklāt uzlabotās S3000 izšķirtspējas rezultātā vienā šūnā tiek atklāts lielāks gēnu un UMI skaits, kas ļauj daudz precīzāk analizēt telpiskās transkripcijas modeļus un šūnu klasterizāciju.
-
DNBSEQ iepriekš izveidotas bibliotēkas
DNBSEQ, ko izstrādājis MGI, ir novatoriska NGS tehnoloģija, kas ir spējusi vēl vairāk samazināt secības izmaksas un palielināt caurlaidspēju. DNBSEQ bibliotēku sagatavošana ietver DNS fragmentāciju, ssDNS sagatavošanu un ritošā apļa amplifikāciju, lai iegūtu DNS nanobumbiņas (DNB). Pēc tam tos uzlādē uz cietas virsmas un pēc tam sekvencē ar kombinatorisko zondes-enkura sintēzi (cPAS). DNBSEQ tehnoloģija apvieno priekšrocības, ko sniedz zems pastiprināšanas kļūdu līmenis, ar augsta blīvuma kļūdu modeļu izmantošanu ar nanobumbiņām, kā rezultātā tiek nodrošināta lielāka caurlaidspēja un precizitāte.
Mūsu iepriekš sagatavotais bibliotēku sekvencēšanas pakalpojums ļauj klientiem sagatavot Illumina sekvencēšanas bibliotēkas no dažādiem avotiem (mRNS, visa genoma, amplikona, 10x bibliotēkām, cita starpā), kuras mūsu laboratorijās tiek pārveidotas par MGI bibliotēkām, lai tās varētu sekvencēt DNBSEQ-T7. liels datu apjoms par zemākām izmaksām.
-
Hi-C balstīta hromatīna mijiedarbība
Hi-C ir metode, kas paredzēta genoma konfigurācijas uztveršanai, apvienojot uz tuvumu balstītas mijiedarbības un augstas caurlaidspējas sekvencēšanu. Metodes pamatā ir hromatīna šķērssaistīšana ar formaldehīdu, kam seko sagremošana un atkārtota ligēšana tādā veidā, ka tikai kovalenti saistīti fragmenti veido ligācijas produktus. Sekvenējot šos ligācijas produktus, ir iespējams izpētīt genoma 3D organizāciju. Hi-C ļauj izpētīt to genoma daļu sadalījumu, kas ir viegli iepakotas (A nodalījumi, eihromatīns) un, visticamāk, ir transkripcijas ziņā aktīvi, un reģionus, kas ir ciešāk iesaiņoti (B nodalījumi, Heterohromatīns). Hi-C var izmantot arī, lai precīzi noteiktu topoloģiski saistītos domēnus (TAD), genoma reģionus, kuriem ir salocīta struktūra un kuriem, iespējams, ir līdzīgi ekspresijas modeļi, un lai identificētu hromatīna cilpas, DNS reģionus, kas ir savienoti kopā ar olbaltumvielām un kas ir bieži bagātināts ar regulējošiem elementiem. BMKGene Hi-C sekvencēšanas pakalpojums dod pētniekiem iespēju izpētīt genomikas telpiskās dimensijas, paverot jaunas iespējas, lai izprastu genoma regulējumu un tā ietekmi uz veselību un slimībām.
-
TGuide Smart Magnetic Plant RNS komplekts
TGuide Smart Magnetic Plant RNS komplekts
Attīriet augstas kvalitātes kopējo RNS no augu audiem
-
TGuide viedais asins/šūnu/audu RNS komplekts
TGuide viedais asins/šūnu/audu RNS komplekts
Iepriekš uzpildīts kārtridžu/plākšņu reaģentu komplekts augstas ražības, augstas tīrības, augstas kvalitātes, inhibitoru nesaturošas kopējās RNS attīrīšanai no dzīvnieku audiem/šūnām/svaigām pilnām asinīm.
-
TGuide viedā magnētiskā auga DNS komplekts
TGuide viedā magnētiskā auga DNS komplekts
Attīriet augstas kvalitātes genoma DNS no dažādiem augu audiem
-
TGuide Smart Soil / Stool DNS komplekts
TGuide Smart Soil / Stool DNS komplekts
Attīra augstas tīrības un kvalitātes DNS nesaturošus inhibitorus no augsnes un izkārnījumu paraugiem
-
TGuide viedais DNS attīrīšanas komplekts
Atgūst augstas kvalitātes DNS no PCR produkta vai agarozes gēliem.
-
TGuide Smart Blood Genomic DNS komplekts
TGuide Smart Blood Genomic DNS komplekts
Iepriekš uzpildīts kārtridžu/plākšņu reaģentu komplekts genoma DNS attīrīšanai no asinīm un buffy coat
-
TGuide viedais magnētisko audu DNS komplekts
Iepriekš uzpildīts kārtridžu/plāksnīšu reaģentu komplekts genoma DNS ekstrakcijai no dzīvnieku audiem
-
TGuide viedais universālais DNS komplekts
Iepriekš uzpildīts kārtridžu/plāksnīšu reaģentu komplekts genoma DNS attīrīšanai no asinīm, izžuvušiem asins plankumiem, baktērijām, šūnām, siekalām, mutes tamponiem, dzīvnieku audiem utt.
-
TGuide S16 nukleīnskābju ekstraktors
TGuide S16 nukleīnskābju ekstraktors
Viegli lietojams galda instruments, 1-8 vai 16 paraugi vienlaicīgi
Kataloga numurs / iepakojums
kat. nē
ID
Sagatavošanas darbu skaits
OSE-S16-AM
1 komplekts
-
PacBio 2+3 pilna garuma mRNS šķīdums
Lai gan uz NGS balstīta mRNS sekvencēšana ir daudzpusīgs rīks gēnu ekspresijas kvantitatīvai noteikšanai, tās paļaušanās uz īsiem nolasījumiem ierobežo tās efektivitāti sarežģītās transkriptomiskās analīzēs. No otras puses, PacBio sekvencēšanā (Iso-Seq) tiek izmantota ilgstošas lasīšanas tehnoloģija, kas ļauj secināt pilna garuma mRNS transkriptus. Šī pieeja atvieglo visaptverošu alternatīvas savienošanas, gēnu saplūšanas un poliadenilācijas izpēti, lai gan tā nav galvenā izvēle gēnu ekspresijas kvantitatīvai noteikšanai. Kombinācija 2+3 mazina plaisu starp Illumina un PacBio, paļaujoties uz PacBio HiFi nolasījumiem, lai identificētu visu transkripta izoformu komplektu un NGS sekvencēšanu, lai kvantitatīvi noteiktu identiskās izoformas.
Platformas: PacBio Sequel II/ PacBio Revio un Illumina NovaSeq;
