Integrētās pieejas mikrobiomu analīzē
- No nukleīnskābju ekstrakcijas līdz sekvencēšanas tehnoloģijām
Mikrobu kopienu augstas caurlaidības sekvencēšanas pētījumi ir kļuvuši plaši izplatīti un ir ievērojami uzlabojuši mūsu izpratni par cilvēku, vides un dzīvnieku mikrobiomu.
Šajā tīmekļa seminārā Ana Vila-Santa, Biomarker Technologies lauka lietojumu zinātniece, apspriež divas pamata sekvencēšanas metodes, kas ir būtiskas mikrobiomu pētījumos: amplikonu sekvencēšana un bises metagenomika. Viņa palīdz mums veikt salīdzinošu analīzi par īstermiņa (piemēram, Illumina) un ilgi lasāmām (piemēram, Nanopore, PacBio) sekvencēšanas tehnoloģijām, novērtējot to veiktspēju dažādiem studiju mērķiem.
Pēc tam Dr. Cui, TIANGEN eksporta tirgus komandas produktu vadītājs, pāriet uz automatizētu nukleīnskābju ekstrakcijas risinājumu sasniegumiem. Viņa pēta ar mikroorganismu paraugiem saistītos principus, metodes un izaicinājumus, kuru kulminācija ir mūsdienīgas automatizētas nukleīnskābju ekstrakcijas (NAE) platformas ieviešana. Dr Cui sniedz padziļinātu pārskatu par TIANGEN visaptverošo risinājumu paraugu sagatavošanai un nukleīnskābju analīzei mikrobiomu pētījumos, risinot nākotnes izaicinājumus un uzlabojumus.