Dažādu sekvencēšanas tehnoloģiju veiktspēja metagenomikas risināšanā.
Šajā lekcijā viņa sniedz ievadu par dažādu sekvencēšanas tehnoloģiju pielietojumu mikrobioma izpratnē, tostarp to tehniskajām darbplūsmām, priekšnesumiem un dažu gadījumu izpēti. Saruna aptvers šādus aspektus:
● Vispārīgs ievads par pašreizējām mikrobiomu profilēšanas metodēm
● Uz amplikoniem balstīta metabarkodēšanas secība: no parauga sagatavošanas līdz datu interpretācijai
● Ko vēl varam sagaidīt no metabarkodēšanas: uz PacBio balstīta pilna garuma amplikonu sekvencēšana
● Metagenomu sekvencēšana šautenē, lai iegūtu visaptverošāku priekšstatu par funkcionālajiem gēniem
● Nanoporu bāzes metagenomu sekvencēšana