Transkripts ir saikne starp genoma ģenētisko informāciju un bioloģiskās funkcijas proteomu. Transkripcijas līmeņa regulēšana ir vissvarīgākais un visplašāk pētītais organismu regulēšanas veids. Transkripta sekvencēšana var secināt transkriptu jebkurā laika vai jebkura stāvokļa brīdī, ar izšķirtspēju, kas ir precīza uz vienu nukleotīdu. Parauga specifiski stenogrammas.
Pašlaik transkriptu sekvencēšanas tehnoloģija ir plaši izmantota agronomijā, medicīnā un citās pētniecības jomās, ieskaitot dzīvnieku un augu attīstības regulēšanu, vides adaptāciju, imūno mijiedarbību, gēnu lokalizāciju, sugu ģenētisko evolūciju un audzēju un ģenētisko slimību noteikšanu.
