lncrna

Ilgas nekodējošas RNS (lncRNS) ir RNS garākas par 200 nukleotīdiem ar zemu kodēšanas potenciālu, bet ar kritiskām regulatīvajām funkcijām. BMKCloud lncRNS cauruļvads ir paredzēts, lai analizētu rRNS noplicinātās bibliotēkas ar augstas kvalitātes, labi anotētu atsauces genomu, analizējot lncRNS un mRNS ekspresiju kopā. Pēc lasīšanas apgriešanas un kvalitātes kontroles nolasījumi tiek saskaņoti ar atsauces genomu, lai saliktu transkriptus, un sekojošā gēnu struktūras analīze atklāj alternatīvu splicēšanu un jaunus gēnus. Stenogrammas tiek identificētas kā mRNS vai lncRNS, un diferenciālās ekspresijas analīze identificē diferencēti izteiktas lncRNS, to mērķus un diferencēti izteiktus gēnus (DEG). Lai atrastu bagātinātas funkcionālās kategorijas, ir funkcionāli anotēti gan DEG, gan diferencēti izteikti lncRNS mērķi.