Genoma mēroga asociācijas pētījuma (GWAS) mērķis ir identificēt ģenētiskos variantus (genotips), kas saistīti ar īpašām pazīmēm (fenotips). GWA pētījumi pēta ģenētiskos marķierus, kas šķērso lielu skaitu indivīdu genomu un prognozē genotipa-fenotipa asociācijas ar statistisko analīzi populācijas līmenī. Visu genoma atjaunošana var potenciāli atklāt visus ģenētiskos variantus. Sadaloties ar fenotipiskiem datiem, GWAS var apstrādāt, lai identificētu ar fenotipu saistītus SNP, QTL un kandidātu gēnus, kas stingri atbalsta mūsdienīgu dzīvnieku/augu selekciju. SLAF ir pašattīstīta vienkāršota genoma sekvencēšanas stratēģija, kas atklāj genoma mēroga izplatītos marķierus SNP. Šos SNP kā molekulāros ģenētiskos marķierus var apstrādāt asociācijas pētījumiem ar mērķtiecīgām pazīmēm. Tā ir rentabla stratēģija, lai identificētu ar sarežģītām iezīmēm saistītās ģenētiskās variācijas.
