Eikariotu mRNS sekvencēšana-NGS
Funkcijas
● Poli mRNS uztveršana pirms bibliotēkas sagatavošanas
● Izvēles virziena mRNS bibliotēkas sagatavošana, lai varētu iegūt virknei specifiskus secības datus
● gēnu ekspresijas un stenogrammas struktūras bioinformātiskā analīze
Priekšrocības
●Plaša kompetence: Mūsu komanda ir apstrādājusi vairāk nekā 600 000 paraugu pie Bmkgene, aptverot dažādus paraugu veidus, piemēram, šūnu kultūras, audus un ķermeņa šķidrumus. Katram projektam mēs sniedzam lielu pieredzi un esam veiksmīgi pabeiguši vairāk nekā 100 000 mRNS-seq projektu dažādās pētniecības jomās.
●Stingra kvalitātes kontrole: Mēs ieviešam galvenos vadības punktus visos posmos, sākot no parauga un bibliotēkas sagatavošanas līdz secībai un bioinformātikai. Šī rūpīgā uzraudzība nodrošina pastāvīgi augstas kvalitātes rezultātu piegādi, nodrošinot, ka jūsu projekts ir uzticamās rokās.
●Visaptveroša anotācija: Mēs izmantojam vairākas datu bāzes, lai funkcionāli anotētu diferenciāli izteiktos gēnus (DEG) un veiktu atbilstošas bagātināšanas analīzes. Šī visaptverošā pieeja sniedz ieskatu šūnu un molekulārajos procesos, kas ir transkripta reakcijas pamatā, nodrošinot, ka esat pilnībā informēts par sava projekta rezultātiem.
●Pēcpārdošanas atbalsts: Mūsu apņemšanās pārsniedz projekta pabeigšanu ar 3 mēnešu pēcpārdošanas dienesta periodu. Šajā laikā mēs piedāvājam projektu turpinājumu, palīdzības novēršanu un Q&A sesijas, lai risinātu visus rezultātus saistītos jautājumus.
Parauga prasības un piegāde
| Bibliotēka | Sekvencēšanas stratēģija | Ieteicamie dati | Kvalitātes kontrole |
| Poli A bagātināts | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6 -10 GB | Q30≥85% |
Parauga prasības:
Nukleotīdi:
| Konc. (Ng/μl) | Daudzums (μg) | Tīrība | Godīgums | |
| Standarta bibliotēka | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280 = 1,7–2,5 OD260/230 = 0,5–2,5 Ierobežots vai bez olbaltumvielu vai DNS piesārņojuma, kas parādīts uz gēla. | Augiem: rin ≥4,0; Dzīvniekiem: Rin ≥4,5; 5,0 ≥28s/18S≥1,0; ierobežots vai nav sākotnējais augstums |
| Virziena bibliotēka | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280 = 1,7–2,5 OD260/230 = 0,5–2,5 Ierobežots vai bez olbaltumvielu vai DNS piesārņojuma, kas parādīts uz gēla. | Augiem: rin ≥4,0; Dzīvniekiem: Rin ≥4,5; 5,0 ≥28s/18S≥1,0; ierobežots vai nav sākotnējais augstums |
● Augi:
Sakne, kāts vai ziedlapa: 450 mg
Lapa vai sēkla: 300 mg
Augļi: 1,2 g
●Dzīvnieks:
Sirds vai zarnas: 300 mg
Iekšējo orgeru vai smadzenes: 240 mg
Muskulis: 450 mg
Kauli, mati vai āda: 1g
● Piesaista:
Kukaiņi: 6g
Crustacea: 300 mg
● pilnas asinis: 1 caurule
● šūnas: 106 šūnās
Ieteicamā parauga piegāde
Konteiners: 2 ml centrifūgas caurule (nav ieteicams alvas folija)
Parauga marķēšana: grupa+replicate, piemēram, A1, A2, A3; B1, B2, B3 ... ...
Sūtījums:
1. Sausais ledus: Paraugi jāiesaiņo maisos un jāapglabā sausā ledus.
2. RNA tabulas caurules: RNS paraugus var žāvēt RNS stabilizācijas caurulē (piemēram, RNastable®) un nosūtīt istabas temperatūrā.
Servisa darba plūsma
Eksperimenta dizains
Paraugu piegāde
RNS ekstrakcija
Bibliotēkas celtniecība
Sekvencēšana
Datu analīze
Pēcpārdošanas pakalpojumi
Bioinformātika
Eikariotu mRNS sekvencēšanas analīzes darbplūsma
Bioinformātika
ØNeapstrādātu datu kvalitātes kontrole
ØAtsauces genoma izlīdzināšana
ØStenogrammas struktūras analīze
ØIzteiksmes kvantitatīvā noteikšana
ØDiferenciālās izpausmes analīze
ØFunkciju anotācija un bagātināšana
Atsauces genoma izlīdzināšana
Datu piesātinājums
Parauga korelācija un bioloģisko atkārtojumu novērtēšana
Diferencēti izteikti gēni (DEG)
DEG funkcionālā anotācija
DEG funkcionālā bagātināšana
Izpētiet sasniegumus, ko atvieglo Bmkgene eikariotu NGS mRNS sekvencēšanas pakalpojumi, izmantojot izstrādātu publikāciju kolekciju.
Huangs, L. et al. (2023) “Triklozāns un triklokarbans vājina zelta zivtiņu ožas spēju, ierobežojot smaku atpazīšanu, pārtraucot ožas signāla pārraidi un traucējot ožas informācijas apstrādi”, ūdens izpēte, 233, p. 119736. Doi: 10.1016/j.watres.2023.119736.
Jia, LJ et al. (2023) “Aspergillus fumigatus nolaupiet cilvēku P11, lai novirzītu sēnīšu saturošas fagosomas uz nedegradatīvu ceļu”, šūnu saimnieks un mikrobs, 31 (3), 373.-388.e10. Lpp. doi: 10.1016/j.chom.2023.02.002.
Jin, K. et al. (2022) “TCP transkripcijas faktori, kas saistīti ar MA bambusa (Dendrocalamus latiflorus munro) dzinumu attīstību”, robežas augu zinātnē, 13, 1. lpp. 884443. Doi: 10.3389/fpls.2022.884443/bibtex.
Wen, X. et al. (2022) “Chrysanthemum lavandulifolium genoms un molekulārais mehānisms, kas ir dažādu galvaspilsētas tipu pamatā”, dārzkopības pētījumi, 9. Doi: 10.1093/h/uhab022.
Džan, Yujie et al. (2023) “Kaskādes nanoreaktors sonodinamiskās terapijas uzlabošanai uz kolorektālā vēža, izmantojot sinerģisku ROS papildinājumu un autofagijas aizsprostojumu”, Nano šodien, 49, lpp. 101798. Doi: 10.1016/j.nantod.2023.101798.
