DNBSEQ iepriekš izveidotas bibliotēkas
Funkcijas
●Platforma:MGI-DNBSEQ-T7
●Sekvences režīmi:PE150
●Illumina bibliotēku pārsūtīšana uzMGI:kas nodrošina lielu datu apjomu secību par zemām izmaksām.
●Bibliotēku kvalitātes kontrole pirms sekvencēšanas.
●Secības datu kvalitātes kontrole un piegāde:QC ziņojuma un neapstrādātu datu piegāde fastq formātā pēc Q30 nolasījumu demultipleksēšanas un filtrēšanas.
Priekšrocības
●Sekvencēšanas pakalpojumu daudzpusība:klients var izvēlēties secību pēc joslas vai datu apjoma.
●Augsta datu izvade:1500 Gb/joslā
●Secības kvalitātes kontroles ziņojuma piegāde:ar kvalitātes metriku, datu precizitāti un sekvencēšanas projekta vispārējo veiktspēju.
●Nobriedušu sekvencēšanas process:ar īsu izpildes laiku.
●Stingra kvalitātes kontrole: mēs ieviešam stingras kvalitātes kontroles prasības, lai garantētu nemainīgi augstas kvalitātes rezultātu piegādi.
Prasību paraugs
| Datu apjoms (X) | Koncentrācija (qPCR/nM) | Apjoms | |
| Daļēja josla
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
| Viena josla | Per Lane | ≥ 1,5 nM / bibliotēkas fonds | ≥ 25 μl / Bibliotēkas baseins |
Papildus koncentrācijai un kopējam daudzumam ir nepieciešams arī piemērots maksimuma modelis.
Piezīme. Zemas daudzveidības bibliotēku joslu sekvencēšanai ir nepieciešama PhiX spike-in, lai nodrošinātu stabilu bāzes izsaukšanu.
Mēs iesakām iesniegt iepriekš apkopotās bibliotēkas kā paraugus. Ja jums ir nepieciešams BMKGENE, lai veiktu bibliotēku apvienošanu, lūdzu, skatiet
bibliotēkas prasības daļējai joslu secībai.
Bibliotēkas lielums (virsotnes karte)
Galvenajam maksimumam jābūt 300–450 bp robežās.
Bibliotēkām jābūt vienam galvenajam maksimumam, bez adaptera piesārņojuma un bez grunts dimeriem.
Pakalpojuma darbplūsma
Bibliotēkas kvalitātes kontroles ziņojums
Pirms secības, bibliotēkas apjoma un sadrumstalotības novērtēšanas tiek sniegts ziņojums par bibliotēkas kvalitāti.
Secības kvalitātes kontroles ziņojums
1. tabula. Statistika par secības datiem.
| Parauga ID | BMKID | Neapstrādāti lasījumi | Neapstrādāti dati (bp) | Tīri lasījumi (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96.00 | 98.95 | 93,89 | 37.08 |
1. attēls. Kvalitātes sadalījums pa nolasījumiem katrā paraugā
2. attēls. Bāzes satura sadalījums
3. attēls. Nolasītā satura sadalījums secības datos
