Exclusive Agency for Korea

条形 Banner-03

Produkti

DNS/RNS sekvencēšana - nanoporu sekvenceris

ONT sekvencēšana ir vienas molekulas reālā laika elektriskā signāla secības tehnoloģija, kuras pamatā ir nanoporas, katras platformas secības princips ir vienāds. Divposma DNS/RNS saistīsies ar nanoporo olbaltumvielām, kas iestrādātas bioplēvē un atpūsties motora olbaltumvielu vadībā, sprieguma starpības iedarbībai no abām bioplēves pusēm DNS/RNS šķipsnas iziet cauri nanoporu kanāla olbaltumvielai pie noteiktas likme. Sakarā ar dažādu bāzu ķīmisko īpašību atšķirībām DNS/RNS virknē, kad viena bāze vai DNS molekula iziet caur nanoporu kanālu, tā izraisīs dažādu elektrisko signālu maiņu. Nosakot un atbilstoši šiem signāliem, var aprēķināt atbilstošos bāzes veidus un var pabeigt secības noteikšanu reāllaikā.


Sīkāka informācija par pakalpojumu

Demonstrācijas rezultāts

Pakalpojuma detaļas funkcijas

Platforma

Bibliotēkas izmērs

Teorētisko datu raža (uz vienu šūnu)

Vienas bāzes precizitāte

Pieteikumi

Nanopore

8KB, 10KB, 20KB, ultralong, cDNS-PCR

70-90GB/šūna

85-92%

SV zvana, de novo, pilna garuma sekvencēšana, ISO-seq, gēnu anotācija, DNS metilēšanas noteikšana

Pakalpojumu priekšrocības

● Vairāk nekā 5 gadu pieredze Pacbio secības platformā ar tūkstošiem slēgtu projektu ar dažādām sugām.
● Bmkgene ir Oxford Nanopore oficiālais partneris ar dubultās platformas RNS/DNS sertifikātu.
● Ir galvenie sekvenču modeļi ar pilnīgu aprīkojumu un pietiekamu secības caurlaidspēju.
● Balstoties uz Nanopore platformu, starptautiski slavenos žurnālos ir publicēti vairāk nekā 10 dzīvnieku un augu Denovo pētījumi.

Parauga prasības


Parauga tips

Summa

Koncentrācija (QUBIT ®)

Tilpums

Tīrība

Citi

Genoma DNS

Atkarīgs no datu prasības

 ≥20 ng/μl

≥15μl

OD260/280 = 1,7-2,2;

OD260/230 ≥1,5 ;

Skaidrs maksimums pie 260 nm , nav piesārņojumu

Koncentrācija jānovērtē ar kvarbitu un qubit/nanopore ≤ 2

Kopējā RNS

≥1,2 μg

≥100 μg/μl

≥15μl

OD260/280 = 1,7–2,5;

OD260/230 = 0,5–2,5 ; Nav piesārņojumu

RIN vērtība ≥7,5

 

Dienesta darbplūsma

Parauga sagatavošana

Parauga sagatavošana

Bibliotēkas sagatavošana

Bibliotēkas celtniecība

Sekvencēšana

Sekvencēšana

Datu analīze

Datu analīze

Paraugs QC

Projektu piegāde


  • Iepriekšējais:
  • Nākamais:

  • DNS parauga datu kvalitātes novērtējums

    1. tabula. Statistika par tīriem datiem.

    Bmkid

    izveicība

    izejviela

    attīrīt

    tīrīšana

    Cleann50Len

    tīrīšana

    tīrs

    cleanmaxlen

    tīrs

    DNA_BMK01

    1 218 239

    26.37

    1,121 736

    25.90

    28 014

    15 764

    23 090

    143,181

    9

    RNS parauga datu kvalitātes novērtējums

    1. tabula. Statistika par tīriem datiem.

    Faila nosaukums

    Klients

    Lasāms

    Bāzenums

    N50

    Vidējais garums

    Maksimālais garums

    Meanqscore

    RNA_BMK001

    C2

    8,947,708

    4,047,230 083

    398

    452

    129 227

    Q12

    1. attēls. Lasīt garuma sadalījums

    A3

    2. attēls. Tīro datu kvalitātes punktu sadalījums

    A4

    3. attēls. Tīro datu garuma un kvalitātes punktu sadalījums

    A5

    Iegūstiet cenu

    Uzrakstiet savu ziņojumu šeit un nosūtiet to mums

    Nosūtiet mums savu ziņojumu: