Illumina iepriekš sagatavotas bibliotēkas
Funkcijas
●Platformas:Illumina NovaSeq 6000 un NovaSeq X Plus
●Sekvences režīmi:PE150 un PE250
●Bibliotēku kvalitātes kontrole pirms secības noteikšanas
●Secības datu kvalitātes kontrole un piegāde:QC ziņojuma un neapstrādātu datu piegāde fastq formātā pēc Q30 nolasījumu demultipleksēšanas un filtrēšanas
Pakalpojuma priekšrocības
●Sekvencēšanas pakalpojumu daudzpusība:klients var izvēlēties secību pēc joslas, plūsmas šūnas vai pēc nepieciešamā datu apjoma (daļēja joslu secība).
●Plaša pieredze Illumina sekvencēšanas platformā:ar tūkstošiem slēgtu projektu ar dažādām sugām.
●Secības kvalitātes kontroles ziņojuma piegāde:ar kvalitātes metriku, datu precizitāti un sekvencēšanas projekta vispārējo veiktspēju.
●Nobriedušu sekvencēšanas process:ar īsu izpildes laiku.
●Stingra kvalitātes kontrole: mēs ieviešam stingras kvalitātes kontroles prasības, lai garantētu nemainīgi augstas kvalitātes rezultātu piegādi.
Platformu paraugi
| Platforma | Plūsmas šūna | Sekvences režīms | Vienība | Paredzamā izlaide |
| NovaSeq X | 10B (8 joslas) | PE150 | Viena josla Daļēja josla | 375 Gb / josla |
| 25B (8 joslas) | PE150 | Viena josla Daļēja josla | 1000 Gb/joslā | |
| NovaSeq 6000 | SP plūsmas šūna (2 joslas) | PE250 | Plūsmas šūna Viena josla Daļēja josla | 325-400 M nolasījumu / Josla |
| S4 plūsmas šūna (4 joslas) | PE150 | Plūsmas šūna Viena josla Daļēja josla | ~800 Gb / josla |
Prasību paraugs
| Datu apjoms (X) | Koncentrācija (qPCR/nM) | Apjoms | |
| Daļēja joslu secība
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 25 μl | |
| Joslu secība | Per Lane | ≥ 1,5 nM / bibliotēkas fonds | ≥ 25 μl / Bibliotēkas baseins |
Papildus koncentrācijai un kopējam daudzumam ir nepieciešams arī piemērots maksimuma modelis.
Piezīme. Zemas daudzveidības bibliotēku joslu sekvencēšanai ir nepieciešama PhiX spike-in, lai nodrošinātu stabilu bāzes izsaukšanu.
Mēs iesakām iesniegt iepriekš apkopotās bibliotēkas kā paraugus. Ja jums ir nepieciešams BMKGENE, lai veiktu bibliotēku apvienošanu, lūdzu, skatiet
bibliotēkas prasības daļējai joslu secībai.
Bibliotēkas lielums (virsotnes karte)
Galvenajam maksimumam jābūt 300–450 bp robežās.
Bibliotēkām jābūt vienam galvenajam maksimumam, bez adaptera piesārņojuma un bez grunts dimeriem.
Lūdzu, sazinieties ar mums, ja jūsu paraugi neatbilst izejmateriāla prasībām.
Pakalpojuma darbplūsma
Bibliotēkas kvalitātes kontrole
Secība
Datu kvalitātes kontrole
Projekta piegāde
Bibliotēkas kvalitātes kontroles ziņojums
Pirms secības, bibliotēkas apjoma un sadrumstalotības novērtēšanas tiek sniegts ziņojums par bibliotēkas kvalitāti.
Secības kvalitātes kontroles ziņojums
1. tabula. Statistika par secības datiem.
| Parauga ID | BMKID | Neapstrādāti lasījumi | Neapstrādāti dati (bp) | Tīri lasījumi (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96.00 | 98.95 | 93,89 | 37.08 |
1. attēls. Kvalitātes sadalījums pa nolasījumiem katrā paraugā
2. attēls. Bāzes satura sadalījums
3. attēls. Nolasītā satura sadalījums secības datos
