● Reikia etaloninio genomo.
● Lambda DNR pridedama, kad būtų galima stebėti bisulfito konversijos efektyvumą.
● „Illumina NovaSeq“ sekos nustatymas.
●Auksinis DNR metilinimo tyrimų standartas: Ši subrendusi metilinimo konvertavimo apdorojimo technologija turi didelį tikslumą ir gerą atkuriamumą.
●Plati aprėptis ir vienos bazės skiriamoji geba:Metilinimo vietų aptikimas viso genomo lygyje.
●Užpildyta platforma:Pateikite puikų „vieno langelio“ paslaugą nuo mėginių apdorojimo, bibliotekų konstrukcijos, sekos nustatymo iki bioinformatikos analizės.
●Didelė patirtis: Vykdydamas WGBS sekos projektus, sėkmingai baigtus įvairiose rūšims, Bmkgene suteikia daugiau nei dešimtmetį patirties, aukštos kvalifikacijos analizės komandą, išsamų turinį ir puikų palaikymą po pardavimo.
●Galimybė prisijungti prie transkriptomikos analizės: Leidžia atlikti integruotą WGB analizę su kitais OMIC duomenimis, tokiais kaip RNR-Seq.
Biblioteka | Sekos strategija | Rekomenduojamas duomenų išvestis | Kokybės kontrolė |
Bisulfitas apdorotas | „Illumina PE150“ | 30x gylis | Q30 ≥ 85% Bisulfito konversija> 99% |
Koncentracija (ng/µl) | Bendras kiekis (µg) | Papildomi reikalavimai | |
Genominė DNR | ≥ 5 | ≥ 400 ng | Ribotas skilimas ar užterštumas |
Apima šią analizę:
● Neapdorota sekos kokybės kontrolė;
● Žemėlapis, susijęs su genomu;
● 5mc metilintų bazių aptikimas;
● metilinimo pasiskirstymo ir anotacijos analizė;
● skirtingai metilintų regionų (DMRS) analizė;
● Funkcinis genų, susijusių su DMR, anotacija.
5mc metilinimo aptikimas: metilintų vietų tipai
Metilinimo žemėlapis. 5mc metilinimo genomo pasiskirstymas
Labai metilintų regionų anotacija
Skirtingi metilintos regionai: susiję genai
Skirtingi metilintos regionai: susijusių genų anotacija (genų ontologija)
Ištirkite tyrimų pažangą, kurią palengvino visas Bmkgene genomo bisulfito sekos nustatymo paslaugos per kurtą leidinių kolekciją.
Ventiliatorius, Y. et al. (2020) „DNR metilinimo profilių analizė avių skeleto raumenų vystymosi metu, naudojant viso genomo bisulfito seką“,BMC genomika, 21 (1), p. 1–15. doi: 10.1186/s12864-020-6751-5.
Zhao, X. et al. (2022) „Nauji dezoksiribonukleorūgščių metilinimo perturbacijos darbuotojams, veikiami vinilo chlorido“,Toksikologija ir pramonės sveikata, 38 (7), p. 377–388. doi: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. ir kt. (2020 m.) „Ryšiai tarp genomo metilinimo, nekoduojančių RNR, mRNR ir metabolitų lygio nokinant pomidorų vaisius“,Augalų žurnalas, 103 (3), p. 980–994. doi: 10.1111/tpj.14778.