Exclusive Agency for Korea

条形 Banner-03

Produktai

Viso genomo bisulo feros seka (WGB)

企业微信截图 _17374388013932

Viso genomo bisulfito sekos nustatymas (WGBS) yra aukso standartinė metodika, skirta nuodugniai tyrinėti DNR metilinimą, ypač penktąją padėtį citozinui (5-MC), pagrindinį genų ekspresijos ir ląstelių aktyvumo reguliatorių. Pagrindinis WGB principas apima gydymą bisulfitu, sukeliančiu nemetilintų citozinų virsmą uracilu (C iki U), o metilintomis citozinais paliekant nepakitusią. Ši technika siūlo vienos bazės skiriamąją gebą, leidžiančią tyrėjams išsamiai ištirti metilomo ir atskleisti nenormalius metilinimo modelius, susijusius su įvairiomis ligomis, ypač vėžiu. Naudodamiesi WGB, mokslininkai gali įgyti neprilygstamų įžvalgų apie viso genomo metilinimo peizažus, suteikdami niuansuotą supratimą apie epigenetinius mechanizmus, kuriais grindžiami įvairūs biologiniai procesai ir ligos.


Išsami paslauga

Bioinformatika

Demonstraciniai rezultatai

Rodomi leidiniai

Aptarnavimo funkcijos

● Reikia etaloninio genomo.

● Lambda DNR pridedama, kad būtų galima stebėti bisulfito konversijos efektyvumą.

● „Illumina NovaSeq“ sekos nustatymas.

Aptarnavimo pranašumai

Auksinis DNR metilinimo tyrimų standartas: Ši subrendusi metilinimo konvertavimo apdorojimo technologija turi didelį tikslumą ir gerą atkuriamumą.

Plati aprėptis ir vienos bazės skiriamoji geba:Metilinimo vietų aptikimas viso genomo lygyje.

Užpildyta platforma:Pateikite puikų „vieno langelio“ paslaugą nuo mėginių apdorojimo, bibliotekų konstrukcijos, sekos nustatymo iki bioinformatikos analizės.

Didelė patirtis: Vykdydamas WGBS sekos projektus, sėkmingai baigtus įvairiose rūšims, Bmkgene suteikia daugiau nei dešimtmetį patirties, aukštos kvalifikacijos analizės komandą, išsamų turinį ir puikų palaikymą po pardavimo.

Galimybė prisijungti prie transkriptomikos analizės: Leidžia atlikti integruotą WGB analizę su kitais OMIC duomenimis, tokiais kaip RNR-Seq.

Imties specifikacijos

Biblioteka

Sekos strategija

Rekomenduojamas duomenų išvestis

Kokybės kontrolė

Bisulfitas apdorotas

„Illumina PE150“

30x gylis

Q30 ≥ 85%

Bisulfito konversija> 99%

Imties reikalavimai

 

Koncentracija (ng/µl)

Bendras kiekis (µg)

Papildomi reikalavimai

Genominė DNR

≥ 5

≥ 400 ng

Ribotas skilimas ar užterštumas

Aptarnavimo darbo srautas

Mėginio pristatymas

Mėginio pristatymas

Piloto eksperimentas

DNR ekstrahavimas

Bibliotekos paruošimas

Bibliotekos statyba

Sekos nustatymas

Sekos nustatymas

Duomenų analizė

Duomenų analizė

数据上传 -01

Duomenų pateikimas


  • Ankstesnis:
  • Kitas:

  • 流程图 羽 4-01

    Apima šią analizę:

    ● Neapdorota sekos kokybės kontrolė;

    ● Žemėlapis, susijęs su genomu;

    ● 5mc metilintų bazių aptikimas;

    ● metilinimo pasiskirstymo ir anotacijos analizė;

    ● skirtingai metilintų regionų (DMRS) analizė;

    ● Funkcinis genų, susijusių su DMR, anotacija.

    5mc metilinimo aptikimas: metilintų vietų tipai

     

    图片 79

     

    Metilinimo žemėlapis. 5mc metilinimo genomo pasiskirstymas

     

    图片 80

     

    Labai metilintų regionų anotacija

    图片 81

    Skirtingi metilintos regionai: susiję genai

     

    图片 82

     

    Skirtingi metilintos regionai: susijusių genų anotacija (genų ontologija)

     

    图片 83

     

    Ištirkite tyrimų pažangą, kurią palengvino visas Bmkgene genomo bisulfito sekos nustatymo paslaugos per kurtą leidinių kolekciją.

    Ventiliatorius, Y. et al. (2020) „DNR metilinimo profilių analizė avių skeleto raumenų vystymosi metu, naudojant viso genomo bisulfito seką“,BMC genomika, 21 (1), p. 1–15. doi: 10.1186/s12864-020-6751-5.

    Zhao, X. et al. (2022) „Nauji dezoksiribonukleorūgščių metilinimo perturbacijos darbuotojams, veikiami vinilo chlorido“,Toksikologija ir pramonės sveikata, 38 (7), p. 377–388. doi: 10.1177/07482337221098600

    Zuo, J. ir kt. (2020 m.) „Ryšiai tarp genomo metilinimo, nekoduojančių RNR, mRNR ir metabolitų lygio nokinant pomidorų vaisius“,Augalų žurnalas, 103 (3), p. 980–994. doi: 10.1111/tpj.14778.

    Gaukite citatą

    Parašykite savo pranešimą čia ir atsiųskite mums

    Atsiųskite mums savo pranešimą: