WGS („Nanopore“)

Viso genomo pakartotinis sekos nustatymas naudojant „Nanopore“ yra populiarus metodas genominiams variantams, ypač struktūriniams variantams (SV), identifikuoti, kurie tiksliau vadinami ilgo skaitymo sekos nustatymu, o ne trumpo skaitymo sekos nustatymu. BMKCloud TGS-WGS (Nanopore) dujotiekis skirtas analizuoti WGS projektų duomenis su Nanopore naudojant aukštos kokybės, gerai anotuotą etaloninį genomą. Analizė prasideda nuo skaitymo apipjaustymo ir kokybės kontrolės, po kurio seka suderinimas su etaloniniu genomu, SV iškvietimas ir su SV susijusių genų funkcinė anotacija naudojant kelias duomenų bazes.