Šilumos žemėlapis
„HeatMap“ įrankis priima „Matrix“ duomenų failą kaip įvestį ir leidžia vartotojams filtruoti, normalizuoti ir suskirstyti duomenis. Pagrindinis šilumos žemėlapių naudojimo atvejis yra grupių genų ekspresijos lygio tarp skirtingų mėginių analizė.
Geno anotacija
„Gene“ anotacijos įrankis atlieka genų anotaciją, pagrįstą įvesties „Fasta“ failų sekos suderinimu su įvairiomis duomenų bazėmis.
Pagrindinis vietinis derinimo paieškos įrankis (BLAST)
„Blast“ įrankis yra „BMKCloud“ integruota „NCBI Blast“ versija ir gali būti naudojama atliekant tas pačias funkcijas, naudojant duomenis, įkeltus į „BMKCloud“ paskyrą.
CDS_UTR prognozė
„CDS_UTR“ numatymo įrankis yra skirtas numatyti kodavimo regionus (CDS) ir nekoduojančias regionus (UTR) nurodytomis nuorašų sekomis, pagrįstomis sprogimo rezultatais prieš žinomas baltymų duomenų bazes ir ORF prognozavimo rezultatus.
Manheteno sklypas
Manheteno siužeto įrankis leidžia eksperimentuoti su aukštais mėginių eksperimentais ir dažniausiai naudojamas viso genomo asociacijos tyrimuose (GWAS).
CIRCOS diagrama
„Circos“ diagramos įrankis suteikia efektyvų vizualizaciją, kaip genomo ypatybės pasiskirsto visame genome. Įprastos savybės apima kiekybinius lokusus, SNP, indels, konstrukcinius ir kopijų skaičiaus variantus.
Gene ontologija (GO) praturtinimas
„Go Enrichment“ įrankis pateikia funkcinę praturtinimo analizę. Pagrindinė šio įrankio programinė įranga yra „Topgo-bioconductor“ paketas, apimantis diferencialinę išraiškos analizę, praturtinimo analizę ir rezultatų vizualizaciją.
Svertinis genų koeficspresijos tinklo analizė (WGCNA)
WGCNA yra plačiai naudojamas duomenų gavybos metodas, skirtas atrasti genų ko ekspresijos modulius. Jis taikomas įvairiems išraiškos duomenų rinkiniui, įskaitant mikrotraumų ir NGS genų ekspresijos duomenis.
Tarpšonkanas
„Interproscan“ įrankis pateikia „Interpro“ baltymų sekų analizę ir klasifikaciją.
Eik Kegg praturtėjimas
„Go Kegg“ praturtėjimo įrankis yra dizainas, skirtas generuoti GO praturtinimo histogramą, KEGG praturtinimo histogramą ir KEGG praturtinimo kelią, remiantis pateiktu genų rinkiniu ir atitinkama anotacija.