Pacbio viso ilgio transkriptas

„PacBio Full-Length Transcriptome Sequencing“, Isoseq, leidžia tiksliai identifikuoti transkripto izoformas, atskleisti alternatyvų poliadenilinimą ir sujungimą bei atlikti tikslesnę genų ekspresijos analizę. „BMKCloud PacBio Full-Length Transcriptome“ dujotiekis yra skirtas analizuoti cDNR bibliotekas, suskirstytas į Circular Consensus Sequencing (CCS) režimą, ir identifikuoja viso ilgio nechimerines (FLNC) sekas, kurios vėliau sugrupuojamos į neperteklinius nuorašus. Vėlesnė BUSCO analizė įvertina transkripto surinkimo išsamumą. Iš surinkto transkripto atliekamos kelios analizės: alternatyvus sujungimas, paprastosios sekos kartojimas (SSR), lncRNR ir atitinkamų tikslinių genų numatymas, naujų genų prognozavimas, genų šeimos analizė, transkripcijos faktoriaus analizė ir transkriptų funkcinė anotacija.